Protein–RNA interactions for Protein: Q12329

HSP42, Heat shock protein 42, yeastyeast

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HSP42Q12329 UBC5YDR059C 447 nt2.77□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 KEI1YDR367W 666 nt2.77□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 HMF1YER057C 390 nt2.77□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 NOP19YGR251W 591 nt2.77□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 YGR293CYGR293C 462 nt2.77□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 IRC21YMR073C 606 nt2.77□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 RPL16BYNL069C 597 nt2.77□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 NGL1YOL042W 1092 nt2.77□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 ORC1YML065W 2745 nt2.77□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 UBP15YMR304W 3693 nt2.77□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 ARK1YNL020C 1917 nt2.77□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 DNA2YHR164C 4569 nt2.77□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 SPB1YCL054W 2526 nt2.77□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 SRB4YER022W 2064 nt2.77□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 UBX3YDL091C 1368 nt2.76□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 YIL080WYIL080W 4722 nt2.76□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 BPT1YLL015W 4680 nt2.76□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.76□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 TOM1YDR457W 9807 nt2.76□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 ECM29YHL030W 5607 nt2.76□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 YGR053CYGR053C 852 nt2.76□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 YJL119CYJL119C 324 nt2.76□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 YBR062CYBR062C 543 nt2.76□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 JJJ2YJL162C 1752 nt2.76□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 NMD2YHR077C 3270 nt2.75□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 MRP10YDL045W-A 288 nt2.75□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt2.75□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 YLR257WYLR257W 966 nt2.75□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 YMR181CYMR181C 465 nt2.75□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 ATG3YNR007C 933 nt2.75□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 MUD1YBR119W 897 nt2.75□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 DYN1YKR054C 12279 nt2.74□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 YLR001CYLR001C 2589 nt2.74□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 TLC1TLC1 1301 nt2.74□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 CSF1YLR087C 8877 nt2.74□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.74□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 PCK1YKR097W 1650 nt2.74□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 NCS2YNL119W 1482 nt2.74□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 PRP21YJL203W 843 nt2.74□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 RPS16AYMR143W 432 nt2.74□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 FPR1YNL135C 345 nt2.74□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 GIM3YNL153C 390 nt2.74□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 RPL25YOL127W 429 nt2.74□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 YPR153WYPR153W 423 nt2.74□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 YGR067CYGR067C 2415 nt2.73□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 snR5snR5 204 nt2.73□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 YDR115WYDR115W 318 nt2.73□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 TMA20YER007C-A 546 nt2.73□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 RRT13YER066W 558 nt2.73□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 YJR087WYJR087W 351 nt2.73□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 VPS63YLR261C 327 nt2.73□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 YMR254CYMR254C 309 nt2.73□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 ISU1YPL135W 498 nt2.73□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 SLP1YOR154W 1764 nt2.73□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt2.72□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt2.72□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt2.72□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 YCL020WYCL020W 1317 nt2.72□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 FAA2YER015W 2235 nt2.72□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 YFH1YDL120W 525 nt2.72□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 YRB1YDR002W 606 nt2.72□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 RPL23BYER117W 414 nt2.72□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt2.72□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 FAR7YFR008W 666 nt2.72□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 MST27YGL051W 705 nt2.72□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 YIP5YGL161C 933 nt2.72□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 Q0144Q0144 330 nt2.72□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 GPI14YJR013W 1212 nt2.72□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 ECM9YKR004C 1134 nt2.72□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 COX8YLR395C 237 nt2.72□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 SGT1YOR057W 1188 nt2.72□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 YOR385WYOR385W 873 nt2.72□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 APC2YLR127C 2562 nt2.72□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 EDS1YBR033W 2760 nt2.72□□□□□ -1.97
HSP42Q12329 YEF3YLR249W 3135 nt2.71□□□□□ -1.98
HSP42Q12329 ERG28YER044C 447 nt2.71□□□□□ -1.98
HSP42Q12329 YGR226CYGR226C 210 nt2.71□□□□□ -1.98
HSP42Q12329 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.71□□□□□ -1.98
HSP42Q12329 ERG29YMR134W 714 nt2.71□□□□□ -1.98
HSP42Q12329 CRS5YOR031W 210 nt2.71□□□□□ -1.98
HSP42Q12329 ATP3YBR039W 936 nt2.71□□□□□ -1.98
HSP42Q12329 SCY1YGL083W 2415 nt2.71□□□□□ -1.98
HSP42Q12329 MSB2YGR014W 3921 nt2.71□□□□□ -1.98
HSP42Q12329 SSP1YHR184W 1716 nt2.71□□□□□ -1.98
HSP42Q12329 YDR338CYDR338C 2088 nt2.7□□□□□ -1.98
HSP42Q12329 CTF13YMR094W 1437 nt2.7□□□□□ -1.98
HSP42Q12329 SDC25YLL016W 3147 nt2.7□□□□□ -1.98
HSP42Q12329 TDA2YER071C 381 nt2.7□□□□□ -1.98
HSP42Q12329 COG2YGR120C 789 nt2.7□□□□□ -1.98
HSP42Q12329 YOL029CYOL029C 606 nt2.7□□□□□ -1.98
HSP42Q12329 HEM4YOR278W 828 nt2.7□□□□□ -1.98
HSP42Q12329 snR191snR191 274 nt2.7□□□□□ -1.98
HSP42Q12329 DNL4YOR005C 2835 nt2.7□□□□□ -1.98
HSP42Q12329 ROY1YMR258C 1662 nt2.69□□□□□ -1.98
HSP42Q12329 DAD1YDR016C 285 nt2.69□□□□□ -1.98
HSP42Q12329 RPS22AYJL190C 393 nt2.69□□□□□ -1.98
HSP42Q12329 SRP21YKL122C 504 nt2.69□□□□□ -1.98
HSP42Q12329 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.69□□□□□ -1.98
HSP42Q12329 YNL046WYNL046W 519 nt2.69□□□□□ -1.98
HSP42Q12329 ESL2YKR096W 3588 nt2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 52.6 ms