Protein–RNA interactions for Protein: P53437

RRN9, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN9, yeastyeast

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN9P53437 JIP3YLR331C 378 nt2.47□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YNL303WYNL303W 348 nt2.47□□□□□ -2.01
RRN9P53437 SFM1YOR021C 642 nt2.47□□□□□ -2.01
RRN9P53437 RRD2YPL152W 1077 nt2.47□□□□□ -2.01
RRN9P53437 PIS1YPR113W 663 nt2.47□□□□□ -2.01
RRN9P53437 KEL2YGR238C 2649 nt2.47□□□□□ -2.01
RRN9P53437 UTP15YMR093W 1542 nt2.47□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YER138CYER138C 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YER160CYER160C 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YJR027WYJR027W 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YML039WYML039W 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YML045WYML045W 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YMR050CYMR050C 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 SEN54YPL083C 1404 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 TDA2YER071C 381 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 MST27YGL051W 705 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 AIM18YHR198C 966 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YHR213WYHR213W 597 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 MRP49YKL167C 414 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 ECM9YKR004C 1134 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 SDO1YLR022C 753 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 ATG38YLR211C 681 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YAR062WYAR062W 597 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 COX8YLR395C 237 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YML037CYML037C 1023 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 GIM3YNL153C 390 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 ATG3YNR007C 933 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 MSN1YOL116W 1149 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 SGT1YOR057W 1188 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 SPB1YCL054W 2526 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 SIR3YLR442C 2937 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 RTT10YPL183C 3042 nt2.46□□□□□ -2.02
RRN9P53437 ESL2YKR096W 3588 nt2.45□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YRR1YOR162C 2433 nt2.45□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YPR014CYPR014C 330 nt2.45□□□□□ -2.02
RRN9P53437 snR191snR191 274 nt2.45□□□□□ -2.02
RRN9P53437 ORC2YBR060C 1863 nt2.45□□□□□ -2.02
RRN9P53437 BCK1YJL095W 4437 nt2.45□□□□□ -2.02
RRN9P53437 RPN3YER021W 1572 nt2.44□□□□□ -2.02
RRN9P53437 VHR1YIL056W 1923 nt2.44□□□□□ -2.02
RRN9P53437 BFR1YOR198C 1413 nt2.44□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YDL163WYDL163W 303 nt2.44□□□□□ -2.02
RRN9P53437 PRP21YJL203W 843 nt2.44□□□□□ -2.02
RRN9P53437 SRP21YKL122C 504 nt2.44□□□□□ -2.02
RRN9P53437 IRC21YMR073C 606 nt2.44□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YMR254CYMR254C 309 nt2.44□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YNL235CYNL235C 432 nt2.44□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YNR025CYNR025C 360 nt2.44□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YOL029CYOL029C 606 nt2.44□□□□□ -2.02
RRN9P53437 SIP3YNL257C 3690 nt2.44□□□□□ -2.02
RRN9P53437 RLI1YDR091C 1827 nt2.44□□□□□ -2.02
RRN9P53437 FUS1YCL027W 1539 nt2.43□□□□□ -2.02
RRN9P53437 TIM11YDR322C-A 291 nt2.43□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.43□□□□□ -2.02
RRN9P53437 CSM4YPL200W 471 nt2.43□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YPR147CYPR147C 915 nt2.43□□□□□ -2.02
RRN9P53437 UBX3YDL091C 1368 nt2.43□□□□□ -2.02
RRN9P53437 DUG2YBR281C 2637 nt2.43□□□□□ -2.02
RRN9P53437 PSK2YOL045W 3306 nt2.43□□□□□ -2.02
RRN9P53437 SUL1YBR294W 2580 nt2.43□□□□□ -2.02
RRN9P53437 MRD1YPR112C 2664 nt2.43□□□□□ -2.02
RRN9P53437 SAK1YER129W 3429 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YLR001CYLR001C 2589 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN9P53437 ERG28YER044C 447 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YJL086CYJL086C 369 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN9P53437 NYV1YLR093C 762 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN9P53437 PDP3YLR455W 915 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YNL150WYNL150W 408 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YPR170CYPR170C 336 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN9P53437 COG3YER157W 2406 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN9P53437 NAB3YPL190C 2409 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN9P53437 APC2YLR127C 2562 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN9P53437 PSD2YGR170W 3417 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN9P53437 CTF13YMR094W 1437 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN9P53437 NPR1YNL183C 2373 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YLR446WYLR446W 1302 nt2.42□□□□□ -2.02
RRN9P53437 snR9snR9 187 nt2.41□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YDR115WYDR115W 318 nt2.41□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YHR054CYHR054C 1065 nt2.41□□□□□ -2.02
RRN9P53437 PEX18YHR160C 852 nt2.41□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YAP7YOL028C 738 nt2.41□□□□□ -2.02
RRN9P53437 MIX23YBL107C 591 nt2.41□□□□□ -2.02
RRN9P53437 TAZ1YPR140W 1146 nt2.41□□□□□ -2.02
RRN9P53437 PHO2YDL106C 1680 nt2.41□□□□□ -2.02
RRN9P53437 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.4□□□□□ -2.02
RRN9P53437 NCS2YNL119W 1482 nt2.4□□□□□ -2.02
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