Protein–RNA interactions for Protein: P48567

PUS4, tRNA pseudouridine synthase 4, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS4P48567 MRP49YKL167C 414 nt3.17□□□□□ -1.9
PUS4P48567 YML116W-AYML116W-A 303 nt3.17□□□□□ -1.9
PUS4P48567 PFK26YIL107C 2484 nt3.17□□□□□ -1.9
PUS4P48567 CWC22YGR278W 1734 nt3.16□□□□□ -1.9
PUS4P48567 SIP3YNL257C 3690 nt3.16□□□□□ -1.9
PUS4P48567 YER084W-AYER084W-A 513 nt3.16□□□□□ -1.9
PUS4P48567 YIR040CYIR040C 333 nt3.16□□□□□ -1.9
PUS4P48567 PAU23YLR037C 375 nt3.16□□□□□ -1.9
PUS4P48567 SHH3YMR118C 591 nt3.16□□□□□ -1.9
PUS4P48567 FYV12YOR183W 390 nt3.16□□□□□ -1.9
PUS4P48567 ALG14YBR070C 714 nt3.16□□□□□ -1.9
PUS4P48567 YBR209WYBR209W 318 nt3.16□□□□□ -1.9
PUS4P48567 TAF1YGR274C 3201 nt3.16□□□□□ -1.9
PUS4P48567 HAA1YPR008W 2085 nt3.16□□□□□ -1.9
PUS4P48567 FLO1YAR050W 4614 nt3.15□□□□□ -1.91
PUS4P48567 DYN1YKR054C 12279 nt3.15□□□□□ -1.91
PUS4P48567 FAP7YDL166C 594 nt3.15□□□□□ -1.91
PUS4P48567 YER038W-AYER038W-A 381 nt3.15□□□□□ -1.91
PUS4P48567 LSM2YBL026W 288 nt3.15□□□□□ -1.91
PUS4P48567 YNR021WYNR021W 1215 nt3.15□□□□□ -1.91
PUS4P48567 YPL039WYPL039W 951 nt3.15□□□□□ -1.91
PUS4P48567 RRD2YPL152W 1077 nt3.15□□□□□ -1.91
PUS4P48567 CDH1YGL003C 1701 nt3.15□□□□□ -1.91
PUS4P48567 NPR1YNL183C 2373 nt3.15□□□□□ -1.91
PUS4P48567 FAR1YJL157C 2493 nt3.14□□□□□ -1.91
PUS4P48567 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt3.14□□□□□ -1.91
PUS4P48567 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.14□□□□□ -1.91
PUS4P48567 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.14□□□□□ -1.91
PUS4P48567 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.14□□□□□ -1.91
PUS4P48567 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.14□□□□□ -1.91
PUS4P48567 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.14□□□□□ -1.91
PUS4P48567 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.14□□□□□ -1.91
PUS4P48567 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.14□□□□□ -1.91
PUS4P48567 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.14□□□□□ -1.91
PUS4P48567 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.14□□□□□ -1.91
PUS4P48567 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.14□□□□□ -1.91
PUS4P48567 USE1YGL098W 738 nt3.14□□□□□ -1.91
PUS4P48567 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt3.14□□□□□ -1.91
PUS4P48567 SAS2YMR127C 1017 nt3.14□□□□□ -1.91
PUS4P48567 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt3.14□□□□□ -1.91
PUS4P48567 PRM3YPL192C 402 nt3.14□□□□□ -1.91
PUS4P48567 snR191snR191 274 nt3.14□□□□□ -1.91
PUS4P48567 PAM1YDR251W 2493 nt3.14□□□□□ -1.91
PUS4P48567 VHR2YER064C 1518 nt3.14□□□□□ -1.91
PUS4P48567 BMS1YPL217C 3552 nt3.13□□□□□ -1.91
PUS4P48567 MSR1YHR091C 1932 nt3.13□□□□□ -1.91
PUS4P48567 SSM4YIL030C 3960 nt3.13□□□□□ -1.91
PUS4P48567 RAD6YGL058W 519 nt3.13□□□□□ -1.91
PUS4P48567 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt3.13□□□□□ -1.91
PUS4P48567 BIG1YHR101C 1008 nt3.13□□□□□ -1.91
PUS4P48567 AIM29YKR074W 468 nt3.13□□□□□ -1.91
PUS4P48567 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.13□□□□□ -1.91
PUS4P48567 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.13□□□□□ -1.91
PUS4P48567 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.13□□□□□ -1.91
PUS4P48567 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.13□□□□□ -1.91
PUS4P48567 PKR1YMR123W 369 nt3.13□□□□□ -1.91
PUS4P48567 HSP10YOR020C 321 nt3.13□□□□□ -1.91
PUS4P48567 YAT2YER024W 2772 nt3.13□□□□□ -1.91
PUS4P48567 BUD4YJR092W 4344 nt3.13□□□□□ -1.91
PUS4P48567 RPA190YOR341W 4995 nt3.13□□□□□ -1.91
PUS4P48567 SNF12YNR023W 1701 nt3.13□□□□□ -1.91
PUS4P48567 MED1YPR070W 1701 nt3.13□□□□□ -1.91
PUS4P48567 MUD2YKL074C 1584 nt3.12□□□□□ -1.91
PUS4P48567 SMB1YER029C 591 nt3.12□□□□□ -1.91
PUS4P48567 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.12□□□□□ -1.91
PUS4P48567 TCD1YHR003C 1290 nt3.12□□□□□ -1.91
PUS4P48567 RMP1YLR145W 606 nt3.12□□□□□ -1.91
PUS4P48567 RPS28BYLR264W 204 nt3.12□□□□□ -1.91
PUS4P48567 YML108WYML108W 318 nt3.12□□□□□ -1.91
PUS4P48567 IRC16YPR038W 360 nt3.12□□□□□ -1.91
PUS4P48567 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.12□□□□□ -1.91
PUS4P48567 YKR078WYKR078W 1758 nt3.12□□□□□ -1.91
PUS4P48567 CDC55YGL190C 1581 nt3.12□□□□□ -1.91
PUS4P48567 YSP2YDR326C 4317 nt3.11□□□□□ -1.91
PUS4P48567 VAC8YEL013W 1737 nt3.11□□□□□ -1.91
PUS4P48567 PPN1YDR452W 2025 nt3.11□□□□□ -1.91
PUS4P48567 AAD3YCR107W 1092 nt3.11□□□□□ -1.91
PUS4P48567 MRH1YDR033W 963 nt3.11□□□□□ -1.91
PUS4P48567 YDR114CYDR114C 303 nt3.11□□□□□ -1.91
PUS4P48567 IES6YEL044W 501 nt3.11□□□□□ -1.91
PUS4P48567 YKL063CYKL063C 504 nt3.11□□□□□ -1.91
PUS4P48567 RPL8BYLL045C 771 nt3.11□□□□□ -1.91
PUS4P48567 YHC1YLR298C 696 nt3.11□□□□□ -1.91
PUS4P48567 IGO1YNL157W 507 nt3.11□□□□□ -1.91
PUS4P48567 PEP12YOR036W 867 nt3.11□□□□□ -1.91
PUS4P48567 COG3YER157W 2406 nt3.11□□□□□ -1.91
PUS4P48567 UTP13YLR222C 2454 nt3.11□□□□□ -1.91
PUS4P48567 MET10YFR030W 3108 nt3.1□□□□□ -1.91
PUS4P48567 SPB1YCL054W 2526 nt3.1□□□□□ -1.91
PUS4P48567 YPL080CYPL080C 327 nt3.1□□□□□ -1.91
PUS4P48567 MMS1YPR164W 4224 nt3.1□□□□□ -1.91
PUS4P48567 COP1YDL145C 3606 nt3.1□□□□□ -1.91
PUS4P48567 FUS1YCL027W 1539 nt3.09□□□□□ -1.91
PUS4P48567 SPO23YBR250W 1572 nt3.09□□□□□ -1.91
PUS4P48567 YDR157WYDR157W 402 nt3.09□□□□□ -1.91
PUS4P48567 TIF35YDR429C 825 nt3.09□□□□□ -1.91
PUS4P48567 GLC3YEL011W 2115 nt3.09□□□□□ -1.91
PUS4P48567 RPL29YFR032C-A 180 nt3.09□□□□□ -1.91
PUS4P48567 RTS3YGR161C 792 nt3.09□□□□□ -1.91
PUS4P48567 YLR297WYLR297W 390 nt3.09□□□□□ -1.91
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