Protein–RNA interactions for Protein: P33301

XRS2, DNA repair protein XRS2, yeast

Predictions only

Length 854 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	P33301	ECM21	YBL101C	3354 nt		3.17	□□□□□ -1.9
XRS2	P33301	YCK2	YNL154C	1641 nt		3.16	□□□□□ -1.9
XRS2	P33301	FIN1	YDR130C	876 nt		3.16	□□□□□ -1.9
XRS2	P33301	RMT2	YDR465C	1239 nt		3.16	□□□□□ -1.9
XRS2	P33301	YDR537C	YDR537C	606 nt		3.16	□□□□□ -1.9
XRS2	P33301	RSR1	YGR152C	819 nt		3.16	□□□□□ -1.9
XRS2	P33301	YHL005C	YHL005C	393 nt		3.16	□□□□□ -1.9
XRS2	P33301	GIC1	YHR061C	945 nt		3.16	□□□□□ -1.9
XRS2	P33301	BAT1	YHR208W	1182 nt		3.16	□□□□□ -1.9
XRS2	P33301	MBB1	YJL199C	327 nt		3.16	□□□□□ -1.9
XRS2	P33301	PAM1	YDR251W	2493 nt		3.16	□□□□□ -1.9
XRS2	P33301	YKL222C	YKL222C	2118 nt		3.16	□□□□□ -1.9
XRS2	P33301	ITC1	YGL133W	3795 nt		3.15	□□□□□ -1.9
XRS2	P33301	MRH1	YDR033W	963 nt		3.15	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	VPS74	YDR372C	1038 nt		3.15	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	DYN2	YDR424C	279 nt		3.15	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	AST2	YER101C	1293 nt		3.15	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	YGR242W	YGR242W	309 nt		3.15	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	IST3	YIR005W	447 nt		3.15	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	RPL6A	YML073C	531 nt		3.15	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	TAP42	YMR028W	1101 nt		3.15	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	NMA111	YNL123W	2994 nt		3.15	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	TLC1	TLC1	1301 nt		3.15	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	PDC2	YDR081C	2778 nt		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	YIL029C	YIL029C	429 nt		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	ILM1	YJR118C	612 nt		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	UBP14	YBR058C	2346 nt		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	NET1	YJL076W	3570 nt		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	YIL169C	YIL169C	2988 nt		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	SKP2	YNL311C	2292 nt		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	IRC2	YDR112W	309 nt		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	TCD1	YHR003C	1290 nt		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	RPL8B	YLL045C	771 nt		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	snR191	snR191	274 nt		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	ILS1	YBL076C	3219 nt		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	CDC55	YGL190C	1581 nt		3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	ICR1	ICR1	3199 nt		3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	CEP3	YMR168C	1827 nt		3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	APC11	YDL008W	498 nt		3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	DBP10	YDL031W	2988 nt		3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	CHZ1	YER030W	462 nt		3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	ERG28	YER044C	447 nt		3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	BET4	YJL031C	984 nt		3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	UBX4	YMR067C	1251 nt		3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	YOR385W	YOR385W	873 nt		3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	VID24	YBR105C	1089 nt		3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	TRS20	YBR254C	528 nt		3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	YME2	YMR302C	2553 nt		3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	SEC7	YDR170C	6030 nt		3.11	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	RPL23B	YER117W	414 nt		3.11	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	YKL033W-A	YKL033W-A	711 nt		3.11	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	VPS20	YMR077C	666 nt		3.11	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	YOR331C	YOR331C	558 nt		3.11	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	RRI2	YOL117W	1938 nt		3.11	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	DSE4	YNR067C	3354 nt		3.11	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	NDT80	YHR124W	1884 nt		3.1	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	RPS26B	YER131W	360 nt		3.1	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	YER175W-A	YER175W-A	165 nt		3.1	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	YIL054W	YIL054W	318 nt		3.1	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	YAL037W	YAL037W	804 nt		3.1	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	MRP49	YKL167C	414 nt		3.1	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	RIM9	YMR063W	720 nt		3.1	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	YMR144W	YMR144W	1029 nt		3.1	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	YOR364W	YOR364W	369 nt		3.1	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	YPR050C	YPR050C	414 nt		3.1	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	AI2	Q0055	2565 nt		3.1	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	BUD4	YJR092W	4344 nt		3.1	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	SEN54	YPL083C	1404 nt		3.1	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	YLR278C	YLR278C	4026 nt		3.09	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	NFT1	YKR103W	3657 nt		3.09	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	ATG13	YPR185W	2217 nt		3.09	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	BMH2	YDR099W	822 nt		3.09	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	PRE1	YER012W	597 nt		3.09	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	YIR020C	YIR020C	303 nt		3.09	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	PHD1	YKL043W	1101 nt		3.09	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	SMA2	YML066C	1110 nt		3.09	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	YMR304C-A	YMR304C-A	351 nt		3.09	□□□□□ -1.91
XRS2	P33301	YDR179W-A	YDR179W-A	1392 nt		3.09	□□□□□ -1.92
XRS2	P33301	BFR1	YOR198C	1413 nt		3.09	□□□□□ -1.92
XRS2	P33301	YIL082W-A	YIL082W-A	4497 nt		3.09	□□□□□ -1.92
XRS2	P33301	YOL057W	YOL057W	2136 nt		3.08	□□□□□ -1.92
XRS2	P33301	DAL5	YJR152W	1632 nt		3.08	□□□□□ -1.92
XRS2	P33301	MES1	YGR264C	2256 nt		3.08	□□□□□ -1.92
XRS2	P33301	TRZ1	YKR079C	2517 nt		3.08	□□□□□ -1.92
XRS2	P33301	YDL009C	YDL009C	324 nt		3.08	□□□□□ -1.92
XRS2	P33301	HMF1	YER057C	390 nt		3.08	□□□□□ -1.92
XRS2	P33301	RRT13	YER066W	558 nt		3.08	□□□□□ -1.92
XRS2	P33301	YIL068W-A	YIL068W-A	384 nt		3.08	□□□□□ -1.92
XRS2	P33301	YNR034W-A	YNR034W-A	297 nt		3.08	□□□□□ -1.92
XRS2	P33301	YAT2	YER024W	2772 nt		3.08	□□□□□ -1.92
XRS2	P33301	SIN3	YOL004W	4611 nt		3.08	□□□□□ -1.92
XRS2	P33301	MOT1	YPL082C	5604 nt		3.08	□□□□□ -1.92
XRS2	P33301	TFC4	YGR047C	3078 nt		3.07	□□□□□ -1.92
XRS2	P33301	TAF2	YCR042C	4224 nt		3.07	□□□□□ -1.92
XRS2	P33301	TIM11	YDR322C-A	291 nt		3.07	□□□□□ -1.92
XRS2	P33301	MTC7	YEL033W	420 nt		3.07	□□□□□ -1.92
XRS2	P33301	YGL042C	YGL042C	306 nt		3.07	□□□□□ -1.92
XRS2	P33301	PRM8	YGL053W	714 nt		3.07	□□□□□ -1.92
XRS2	P33301	YLR252W	YLR252W	306 nt		3.07	□□□□□ -1.92
XRS2	P33301	YOL013W-B	YOL013W-B	291 nt		3.07	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.2 ms