Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD21O60216 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD21O60216 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD21O60216 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD21O60216 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD21O60216 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD21O60216 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD21O60216 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD21O60216 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD21O60216 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD21O60216 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD21O60216 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD21O60216 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD21O60216 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD21O60216 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD21O60216 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD21O60216 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD21O60216 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD21O60216 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD21O60216 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD21O60216 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD21O60216 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD21O60216 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD21O60216 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD21O60216 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD21O60216 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD21O60216 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD21O60216 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD21O60216 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD21O60216 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD21O60216 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAD21O60216 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAD21O60216 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAD21O60216 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD21O60216 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD21O60216 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD21O60216 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD21O60216 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD21O60216 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD21O60216 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD21O60216 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD21O60216 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD21O60216 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD21O60216 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD21O60216 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD21O60216 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD21O60216 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD21O60216 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD21O60216 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD21O60216 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD21O60216 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD21O60216 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD21O60216 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD21O60216 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD21O60216 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD21O60216 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD21O60216 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD21O60216 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD21O60216 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD21O60216 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD21O60216 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD21O60216 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD21O60216 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD21O60216 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD21O60216 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD21O60216 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD21O60216 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD21O60216 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD21O60216 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD21O60216 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD21O60216 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD21O60216 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD21O60216 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD21O60216 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD21O60216 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD21O60216 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD21O60216 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD21O60216 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD21O60216 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD21O60216 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD21O60216 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD21O60216 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD21O60216 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD21O60216 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD21O60216 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD21O60216 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD21O60216 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD21O60216 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD21O60216 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD21O60216 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD21O60216 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD21O60216 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD21O60216 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD21O60216 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD21O60216 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD21O60216 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD21O60216 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD21O60216 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD21O60216 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD21O60216 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms