Protein–RNA interactions for Protein: J3QLW9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLW9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QLW9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QLW9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QLW9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QLW9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QLW9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QLW9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QLW9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QLW9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QLW9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QLW9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QLW9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QLW9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QLW9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QLW9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QLW9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QLW9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
J3QLW9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
J3QLW9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
J3QLW9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QLW9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QLW9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QLW9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QLW9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QLW9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QLW9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QLW9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QLW9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QLW9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QLW9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QLW9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QLW9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QLW9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QLW9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QLW9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QLW9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QLW9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QLW9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QLW9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QLW9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QLW9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QLW9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QLW9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QLW9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QLW9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QLW9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QLW9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QLW9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QLW9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QLW9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QLW9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QLW9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QLW9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QLW9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QLW9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QLW9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QLW9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QLW9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QLW9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QLW9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QLW9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QLW9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QLW9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QLW9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QLW9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QLW9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QLW9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QLW9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QLW9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QLW9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QLW9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QLW9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QLW9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QLW9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QLW9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QLW9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QLW9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QLW9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QLW9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QLW9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QLW9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QLW9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QLW9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QLW9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QLW9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QLW9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QLW9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QLW9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QLW9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QLW9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QLW9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QLW9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QLW9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QLW9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QLW9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QLW9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QLW9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QLW9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QLW9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QLW9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms