Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIPT2A6NK58 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms