Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM106CQ9BVX2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM106CQ9BVX2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM106CQ9BVX2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms