Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
INPP4AQ96PE3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.5 ms