Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q5H1

TY1A-PR3, Transposon Ty1-PR3 Gag polyprotein, yeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RIA1	YNL163C	3333 nt		4.01	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	EMP70	YLR083C	2004 nt		4	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	NUP2	YLR335W	2163 nt		4	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YSW1	YBR148W	1830 nt		4	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	ATP22	YDR350C	2055 nt		4	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YGL152C	YGL152C	678 nt		4	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	NOP19	YGR251W	591 nt		4	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YJL015C	YJL015C	285 nt		4	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YJL197C-A	YJL197C-A	282 nt		4	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PDS5	YMR076C	3834 nt		4	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YOL097W-A	YOL097W-A	186 nt		4	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	OM14	YBR230C	405 nt		4	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YBR230W-A	YBR230W-A	201 nt		4	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SLM6	YBR266C	453 nt		4	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RAD1	YPL022W	3303 nt		4	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	MET4	YNL103W	2019 nt		4	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	BUD5	YCR038C	1929 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YDR183C-A	YDR183C-A	258 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	tK(CUU)C	tK(CUU)C	73 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	tK(CUU)D1	tK(CUU)D1	73 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	tK(CUU)D2	tK(CUU)D2	73 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	tK(CUU)E1	tK(CUU)E1	73 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	tK(CUU)E2	tK(CUU)E2	73 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	tK(CUU)F	tK(CUU)F	73 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	tK(CUU)G1	tK(CUU)G1	73 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	tK(CUU)G2	tK(CUU)G2	73 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	tK(CUU)G3	tK(CUU)G3	73 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	tK(CUU)I	tK(CUU)I	73 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	tK(CUU)J	tK(CUU)J	73 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	tK(CUU)K	tK(CUU)K	73 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	tK(CUU)M	tK(CUU)M	73 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	tK(CUU)P	tK(CUU)P	73 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PAU13	YHL046C	363 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	MSL1	YIR009W	336 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	ECM16	YMR128W	3804 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PHM7	YOL084W	2976 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	GAL11	YOL051W	3246 nt		3.99	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	MPS1	YDL028C	2295 nt		3.98	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YER066C-A	YER066C-A	501 nt		3.98	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YHR139C-A	YHR139C-A	312 nt		3.98	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YJL202C	YJL202C	348 nt		3.98	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	FBP1	YLR377C	1047 nt		3.98	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YMR046W-A	YMR046W-A	129 nt		3.98	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	COX7	YMR256C	183 nt		3.98	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	URA10	YMR271C	684 nt		3.98	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PFY1	YOR122C	381 nt		3.98	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YKL100C	YKL100C	1764 nt		3.98	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YCF1	YDR135C	4548 nt		3.98	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	MES1	YGR264C	2256 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	POL1	YNL102W	4407 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YER091C-A	YER091C-A	222 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RPS0A	YGR214W	759 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PET191	YJR034W	327 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	MRPL20	YKR085C	588 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	FCF2	YLR051C	654 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RPS7B	YNL096C	573 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SEN1	YLR430W	6696 nt		3.97	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	FRE8	YLR047C	2061 nt		3.96	□□□□□ -1.77
TY1A-PR3	Q6Q5H1	CAF130	YGR134W	3369 nt		3.96	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YOL075C	YOL075C	3885 nt		3.96	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RMT2	YDR465C	1239 nt		3.96	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RPL29	YFR032C-A	180 nt		3.96	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	JAC1	YGL018C	555 nt		3.96	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RPS21B	YJL136C	264 nt		3.96	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	LSO1	YJR005C-A	282 nt		3.96	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RPL15A	YLR029C	615 nt		3.96	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RPL37A	YLR185W	267 nt		3.96	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SPC72	YAL047C	1869 nt		3.96	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	VHS3	YOR054C	2025 nt		3.95	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SSH1	YBR283C	1473 nt		3.95	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PRO3	YER023W	861 nt		3.95	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PXR1	YGR280C	816 nt		3.95	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	LSM2	YBL026W	288 nt		3.95	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	LDS2	YOL047C	1071 nt		3.95	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YPL152W-A	YPL152W-A	99 nt		3.95	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	AKL1	YBR059C	3327 nt		3.95	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	OSH6	YKR003W	1347 nt		3.95	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	LYS9	YNR050C	1341 nt		3.95	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PUF3	YLL013C	2640 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	NDD1	YOR372C	1665 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	NOT5	YPR072W	1683 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	MNL1	YHR204W	2391 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YCR097W-A	YCR097W-A	267 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YDR545C-A	YDR545C-A	480 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RIP1	YEL024W	648 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	CAJ1	YER048C	1176 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RAD6	YGL058W	519 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	tW(UCA)Q	tW(UCA)Q	74 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YKL033W-A	YKL033W-A	711 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YNL097W-A	YNL097W-A	156 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YPR077C	YPR077C	372 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	TEL1	YBL088C	8364 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YJR015W	YJR015W	1533 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	CBP2	YHL038C	1893 nt		3.94	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	NRP1	YDL167C	2160 nt		3.93	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	ATG21	YPL100W	1491 nt		3.93	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YDL180W	YDL180W	1644 nt		3.93	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YPK9	YOR291W	4419 nt		3.93	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PMP3	YDR276C	168 nt		3.93	□□□□□ -1.78
TY1A-PR3	Q6Q5H1	GAL83	YER027C	1254 nt		3.93	□□□□□ -1.78

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