Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNI3KQ59H18 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI3KQ59H18 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms