Protein–RNA interactions for Protein: P53437

RRN9, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN9, yeastyeast

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN9P53437 ECI1YLR284C 843 nt2.55□□□□□ -2
RRN9P53437 IKI3YLR384C 4050 nt2.55□□□□□ -2
RRN9P53437 YEL1YBL060W 2064 nt2.55□□□□□ -2
RRN9P53437 RRT16YNL105W 429 nt2.55□□□□□ -2
RRN9P53437 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt2.55□□□□□ -2
RRN9P53437 STI1YOR027W 1770 nt2.55□□□□□ -2
RRN9P53437 YBR062CYBR062C 543 nt2.55□□□□□ -2
RRN9P53437 YCL020WYCL020W 1317 nt2.55□□□□□ -2
RRN9P53437 PCK1YKR097W 1650 nt2.54□□□□□ -2
RRN9P53437 ESC2YDR363W 1371 nt2.54□□□□□ -2
RRN9P53437 HMF1YER057C 390 nt2.54□□□□□ -2
RRN9P53437 YIP1YGR172C 747 nt2.54□□□□□ -2
RRN9P53437 AIM19YIL087C 474 nt2.54□□□□□ -2
RRN9P53437 YJL147CYJL147C 1149 nt2.54□□□□□ -2
RRN9P53437 VPS63YLR261C 327 nt2.54□□□□□ -2
RRN9P53437 RIM9YMR063W 720 nt2.54□□□□□ -2
RRN9P53437 ISW1YBR245C 3390 nt2.54□□□□□ -2
RRN9P53437 POL3YDL102W 3294 nt2.53□□□□□ -2
RRN9P53437 MAL33YBR297W 1407 nt2.53□□□□□ -2
RRN9P53437 ECM21YBL101C 3354 nt2.53□□□□□ -2
RRN9P53437 PBP4YDL053C 558 nt2.53□□□□□ -2
RRN9P53437 YDR193WYDR193W 399 nt2.53□□□□□ -2
RRN9P53437 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt2.53□□□□□ -2
RRN9P53437 ILV5YLR355C 1188 nt2.53□□□□□ -2
RRN9P53437 RCE1YMR274C 948 nt2.53□□□□□ -2
RRN9P53437 HEM4YOR278W 828 nt2.53□□□□□ -2
RRN9P53437 SHS1YDL225W 1656 nt2.53□□□□□ -2
RRN9P53437 YCT1YLL055W 1596 nt2.53□□□□□ -2.01
RRN9P53437 NUM1YDR150W 8247 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YKL075CYKL075C 1353 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN9P53437 AXL1YPR122W 3627 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN9P53437 TRA1YHR099W 11235 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YOR296WYOR296W 3870 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN9P53437 APC11YDL008W 498 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN9P53437 RPL14BYHL001W 417 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YIL054WYIL054W 318 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN9P53437 RNR2YJL026W 1200 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN9P53437 ASG7YJL170C 630 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN9P53437 APC9YLR102C 798 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN9P53437 LCL1YPL056C 306 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN9P53437 ACM1YPL267W 630 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YCL007CYCL007C 393 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN9P53437 REF2YDR195W 1602 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN9P53437 ALY1YKR021W 2748 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN9P53437 KAR9YPL269W 1935 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YDR042CYDR042C 603 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN9P53437 BAT1YHR208W 1182 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YIL012WYIL012W 342 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YET1YKL065C 621 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN9P53437 RPL8BYLL045C 771 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YLR012CYLR012C 300 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN9P53437 CWC24YLR323C 780 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN9P53437 MPP6YNR024W 561 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YLR108CYLR108C 1458 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN9P53437 TOP2YNL088W 4287 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN9P53437 DSF2YBR007C 2211 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN9P53437 MMS1YPR164W 4224 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN9P53437 HYP2YEL034W 474 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YKL123WYKL123W 381 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN9P53437 SRL4YPL033C 846 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YBR051WYBR051W 351 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN9P53437 SGM1YJR134C 2124 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN9P53437 PBS2YJL128C 2007 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN9P53437 MSB2YGR014W 3921 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN9P53437 SSP1YHR184W 1716 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN9P53437 snR5snR5 204 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN9P53437 RSM18YER050C 417 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YIP5YGL161C 933 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN9P53437 MND1YGL183C 660 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YOR152CYOR152C 771 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN9P53437 SSN2YDR443C 4263 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN9P53437 SMY2YBR172C 2223 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN9P53437 SRO77YBL106C 3033 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN9P53437 ESC1YMR219W 4977 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YKU80YMR106C 1890 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YCR090CYCR090C 549 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN9P53437 DAD1YDR016C 285 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN9P53437 SNO3YFL060C 669 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN9P53437 ERP6YGL002W 651 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YGR053CYGR053C 852 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN9P53437 MTM1YGR257C 1101 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YIL082WYIL082W 873 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YAL037WYAL037W 804 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN9P53437 SNO2YNL334C 669 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN9P53437 snR189snR189 189 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN9P53437 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN9P53437 YOL057WYOL057W 2136 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN9P53437 MES1YGR264C 2256 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN9P53437 SCY1YGL083W 2415 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN9P53437 TRM2YKR056W 1920 nt2.47□□□□□ -2.01
RRN9P53437 SYS1YJL004C 612 nt2.47□□□□□ -2.01
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