Protein–RNA interactions for Protein: P29056

BRF1, Transcription factor IIIB 70 kDa subunit, yeastyeast

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRF1P29056 LIN1YHR156C 1023 nt2.86□□□□□ -1.95
BRF1P29056 SYS1YJL004C 612 nt2.86□□□□□ -1.95
BRF1P29056 YPT52YKR014C 705 nt2.86□□□□□ -1.95
BRF1P29056 ATG3YNR007C 933 nt2.86□□□□□ -1.95
BRF1P29056 YOL134CYOL134C 390 nt2.86□□□□□ -1.95
BRF1P29056 YPR050CYPR050C 414 nt2.86□□□□□ -1.95
BRF1P29056 KRE33YNL132W 3171 nt2.86□□□□□ -1.95
BRF1P29056 AGE1YDR524C 1449 nt2.85□□□□□ -1.95
BRF1P29056 YLR108CYLR108C 1458 nt2.85□□□□□ -1.95
BRF1P29056 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.85□□□□□ -1.95
BRF1P29056 YDR203WYDR203W 318 nt2.85□□□□□ -1.95
BRF1P29056 YDR262WYDR262W 819 nt2.85□□□□□ -1.95
BRF1P29056 RSM28YDR494W 1086 nt2.85□□□□□ -1.95
BRF1P29056 OTU2YHL013C 924 nt2.85□□□□□ -1.95
BRF1P29056 CAP1YKL007W 807 nt2.85□□□□□ -1.95
BRF1P29056 LIP2YLR239C 987 nt2.85□□□□□ -1.95
BRF1P29056 RPL23AYBL087C 414 nt2.85□□□□□ -1.95
BRF1P29056 MBA1YBR185C 837 nt2.85□□□□□ -1.95
BRF1P29056 ORC1YML065W 2745 nt2.85□□□□□ -1.95
BRF1P29056 BIT61YJL058C 1632 nt2.85□□□□□ -1.95
BRF1P29056 RIM13YMR154C 2184 nt2.84□□□□□ -1.95
BRF1P29056 MSB2YGR014W 3921 nt2.84□□□□□ -1.95
BRF1P29056 YBT1YLL048C 4986 nt2.84□□□□□ -1.95
BRF1P29056 BUB1YGR188C 3066 nt2.84□□□□□ -1.95
BRF1P29056 RPL11BYGR085C 525 nt2.84□□□□□ -1.95
BRF1P29056 RPL16BYNL069C 597 nt2.84□□□□□ -1.95
BRF1P29056 CSI2YOL007C 1026 nt2.84□□□□□ -1.95
BRF1P29056 MSN1YOL116W 1149 nt2.84□□□□□ -1.95
BRF1P29056 RPL11AYPR102C 525 nt2.84□□□□□ -1.95
BRF1P29056 NTC20YBR188C 423 nt2.84□□□□□ -1.95
BRF1P29056 LST4YKL176C 2487 nt2.84□□□□□ -1.96
BRF1P29056 SIR3YLR442C 2937 nt2.84□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.84□□□□□ -1.96
BRF1P29056 GCD10YNL062C 1437 nt2.84□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YCR013CYCR013C 648 nt2.83□□□□□ -1.96
BRF1P29056 NOP19YGR251W 591 nt2.83□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt2.83□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YLR297WYLR297W 390 nt2.83□□□□□ -1.96
BRF1P29056 AIM36YMR157C 768 nt2.83□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt2.83□□□□□ -1.96
BRF1P29056 CUR1YPR158W 759 nt2.83□□□□□ -1.96
BRF1P29056 TRM2YKR056W 1920 nt2.83□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YPL216WYPL216W 3309 nt2.83□□□□□ -1.96
BRF1P29056 NEL1YHR035W 1893 nt2.82□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YDL158CYDL158C 309 nt2.82□□□□□ -1.96
BRF1P29056 THG1YGR024C 714 nt2.82□□□□□ -1.96
BRF1P29056 PCL5YHR071W 690 nt2.82□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt2.82□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YLR257WYLR257W 966 nt2.82□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YNL050CYNL050C 813 nt2.82□□□□□ -1.96
BRF1P29056 SGT1YOR057W 1188 nt2.82□□□□□ -1.96
BRF1P29056 SUS1YBR111W-A 291 nt2.82□□□□□ -1.96
BRF1P29056 AMS1YGL156W 3252 nt2.81□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YEA4YEL004W 1029 nt2.81□□□□□ -1.96
BRF1P29056 ERP6YGL002W 651 nt2.81□□□□□ -1.96
BRF1P29056 PGD1YGL025C 1194 nt2.81□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YLL044WYLL044W 447 nt2.81□□□□□ -1.96
BRF1P29056 MST28YAR033W 705 nt2.81□□□□□ -1.96
BRF1P29056 ECI1YLR284C 843 nt2.81□□□□□ -1.96
BRF1P29056 NBP1YLR457C 960 nt2.81□□□□□ -1.96
BRF1P29056 PAI3YMR174C 207 nt2.81□□□□□ -1.96
BRF1P29056 NGL1YOL042W 1092 nt2.81□□□□□ -1.96
BRF1P29056 SEC66YBR171W 621 nt2.81□□□□□ -1.96
BRF1P29056 JJJ2YJL162C 1752 nt2.81□□□□□ -1.96
BRF1P29056 STI1YOR027W 1770 nt2.81□□□□□ -1.96
BRF1P29056 ASI3YNL008C 2031 nt2.81□□□□□ -1.96
BRF1P29056 SPB1YCL054W 2526 nt2.81□□□□□ -1.96
BRF1P29056 TRS130YMR218C 3309 nt2.8□□□□□ -1.96
BRF1P29056 SWA2YDR320C 2007 nt2.8□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YER138CYER138C 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YER160CYER160C 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YJR027WYJR027W 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YML039WYML039W 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YML045WYML045W 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YMR050CYMR050C 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.8□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.8□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.8□□□□□ -1.96
BRF1P29056 RRT13YER066W 558 nt2.8□□□□□ -1.96
BRF1P29056 AST2YER101C 1293 nt2.8□□□□□ -1.96
BRF1P29056 SAE2YGL175C 1038 nt2.8□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.8□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YOR385WYOR385W 873 nt2.8□□□□□ -1.96
BRF1P29056 ADF1YCL058W-A 342 nt2.8□□□□□ -1.96
BRF1P29056 SAK1YER129W 3429 nt2.8□□□□□ -1.96
BRF1P29056 SRB4YER022W 2064 nt2.8□□□□□ -1.96
BRF1P29056 DBF20YPR111W 1695 nt2.79□□□□□ -1.96
BRF1P29056 YGR067CYGR067C 2415 nt2.79□□□□□ -1.96
BRF1P29056 MAL33YBR297W 1407 nt2.79□□□□□ -1.96
BRF1P29056 BNR1YIL159W 4128 nt2.79□□□□□ -1.96
BRF1P29056 SLF1YDR515W 1344 nt2.79□□□□□ -1.96
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