Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 YNL150WYNL150W 408 nt3.77□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 DNM1YLL001W 2274 nt3.77□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 POL3YDL102W 3294 nt3.76□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 TAF1YGR274C 3201 nt3.76□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 YDR269CYDR269C 324 nt3.76□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.76□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 NSA2YER126C 786 nt3.76□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 GET1YGL020C 708 nt3.76□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 RPL1BYGL135W 654 nt3.76□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 YHR130CYHR130C 336 nt3.76□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt3.76□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 YIR040CYIR040C 333 nt3.76□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 SOD1YJR104C 465 nt3.76□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 NNT1YLR285W 786 nt3.76□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 PBI2YNL015W 228 nt3.76□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 TPK2YPL203W 1143 nt3.76□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 RPL1AYPL220W 654 nt3.76□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 SEC15YGL233W 2733 nt3.76□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 ALA1YOR335C 2877 nt3.76□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 AVT5YBL089W 1380 nt3.76□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 SSE2YBR169C 2082 nt3.75□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 FAS1YKL182W 6156 nt3.75□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 ADY4YLR227C 1482 nt3.75□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 NCS2YNL119W 1482 nt3.75□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 TFC1YBR123C 1950 nt3.75□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 SMT3YDR510W 306 nt3.75□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 YER119C-AYER119C-A 372 nt3.75□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 RRF1YHR038W 693 nt3.75□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 YKL063CYKL063C 504 nt3.75□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 VPH2YKL119C 648 nt3.75□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 MCR1YKL150W 909 nt3.75□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 PAI3YMR174C 207 nt3.75□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 PEX11YOL147C 711 nt3.75□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 MSS18YPR134W 807 nt3.75□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 IRC3YDR332W 2070 nt3.74□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 NUP159YIL115C 4383 nt3.74□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 ATG31YDR022C 591 nt3.74□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 YDR262WYDR262W 819 nt3.74□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 CHZ1YER030W 462 nt3.74□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 YER087C-AYER087C-A 552 nt3.74□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 IES5YER092W 378 nt3.74□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 CDC26YFR036W 375 nt3.74□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 YAR047CYAR047C 321 nt3.74□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 RRP5YMR229C 5190 nt3.74□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 YBR012CYBR012C 420 nt3.74□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 SEC66YBR171W 621 nt3.74□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 YTA7YGR270W 4140 nt3.74□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 ARG5,6YER069W 2592 nt3.73□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 MUD2YKL074C 1584 nt3.73□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 AHC2YCR082W 387 nt3.73□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 ARF1YDL192W 546 nt3.73□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 YDL242WYDL242W 354 nt3.73□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 COX23YHR116W 456 nt3.73□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 YNL184CYNL184C 327 nt3.73□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 YOR331CYOR331C 558 nt3.73□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 snR59snR59 78 nt3.72□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 snR68snR68 136 nt3.72□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 CPR5YDR304C 678 nt3.72□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 YHR138CYHR138C 345 nt3.72□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.72□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.72□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 ANB1YJR047C 474 nt3.72□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 YKL044WYKL044W 321 nt3.72□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 RPL13BYMR142C 600 nt3.72□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 DDR48YMR173W 1293 nt3.72□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 AFT2YPL202C 1251 nt3.72□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 YPR050CYPR050C 414 nt3.72□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 RPC40YPR110C 1008 nt3.72□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 YOR296WYOR296W 3870 nt3.72□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 PES4YFR023W 1836 nt3.72□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 TCP1YDR212W 1680 nt3.71□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 DAL5YJR152W 1632 nt3.71□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 ENA2YDR039C 3276 nt3.71□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 ENA1YDR040C 3276 nt3.71□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YGL039WYGL039W 1047 nt3.71□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 AIM29YKR074W 468 nt3.71□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 TDA8YAL064C-A 381 nt3.71□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 DAD2YKR083C 402 nt3.71□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YML003WYML003W 873 nt3.71□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 OST6YML019W 999 nt3.71□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YMR141CYMR141C 309 nt3.71□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 ERG2YMR202W 669 nt3.71□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 TIF11YMR260C 462 nt3.71□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YPR053CYPR053C 456 nt3.71□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 DPB3YBR278W 606 nt3.71□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 RPN3YER021W 1572 nt3.71□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YLR352WYLR352W 2424 nt3.71□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 APC5YOR249C 2058 nt3.71□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YAP3YHL009C 993 nt3.7□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 PCL5YHR071W 690 nt3.7□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YLR224WYLR224W 1110 nt3.7□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YML084WYML084W 309 nt3.7□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 AAR2YBL074C 1068 nt3.7□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 YOR029WYOR029W 336 nt3.7□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 CAT5YOR125C 702 nt3.7□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 LCB4YOR171C 1875 nt3.7□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 BCH1YMR237W 2175 nt3.7□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 PAM1YDR251W 2493 nt3.7□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 DSF2YBR007C 2211 nt3.7□□□□□ -1.82
CLF1Q12309 REC8YPR007C 2043 nt3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 60.1 ms