Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 MAK5YBR142W 2322 nt2.41□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.41□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.41□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.41□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 YCL019WYCL019W 5313 nt2.41□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 YPP1YGR198W 2454 nt2.41□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 SYS1YJL004C 612 nt2.41□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 YKL115CYKL115C 393 nt2.41□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 CUP9YPL177C 921 nt2.41□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 YBR090CYBR090C 369 nt2.41□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 snR43snR43 209 nt2.41□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 ARP5YNL059C 2268 nt2.41□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 ARP8YOR141C 2646 nt2.41□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 ISW1YBR245C 3390 nt2.41□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 DBF20YPR111W 1695 nt2.41□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 TIM11YDR322C-A 291 nt2.4□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 PRE1YER012W 597 nt2.4□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 SAE2YGL175C 1038 nt2.4□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 MIG2YGL209W 1149 nt2.4□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 OST5YGL226C-A 261 nt2.4□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 LIP2YLR239C 987 nt2.4□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 BTS1YPL069C 1008 nt2.4□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 ACM1YPL267W 630 nt2.4□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 snR24snR24 89 nt2.4□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 KAR4YCL055W 1008 nt2.4□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 MRD1YPR112C 2664 nt2.39□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 SGS1YMR190C 4344 nt2.39□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 SVP26YHR181W 687 nt2.39□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 YJL032WYJL032W 315 nt2.39□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 DYN3YMR299C 939 nt2.39□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 YOR055WYOR055W 435 nt2.39□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 RPC40YPR110C 1008 nt2.39□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 RRG8YPR116W 834 nt2.39□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 PSD2YGR170W 3417 nt2.39□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 KEL2YGR238C 2649 nt2.39□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 HOP1YIL072W 1818 nt2.39□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 ATP22YDR350C 2055 nt2.38□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 SMY2YBR172C 2223 nt2.38□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 SGM1YJR134C 2124 nt2.38□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 SMC6YLR383W 3345 nt2.38□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 SYO1YDL063C 1863 nt2.38□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 MVB12YGR206W 306 nt2.38□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 MAK11YKL021C 1407 nt2.38□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 YKU80YMR106C 1890 nt2.38□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 TOP2YNL088W 4287 nt2.38□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 RFC5YBR087W 1065 nt2.38□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 PDR11YIL013C 4236 nt2.37□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 MST27YGL051W 705 nt2.37□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 ERV1YGR029W 570 nt2.37□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt2.37□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 SFT1YKL006C-A 294 nt2.37□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 YKL069WYKL069W 543 nt2.37□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 YKE2YLR200W 345 nt2.37□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 PIS1YPR113W 663 nt2.37□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 YGL176CYGL176C 1665 nt2.37□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 VPS41YDR080W 2979 nt2.37□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 TFB1YDR311W 1929 nt2.36□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 PHO91YNR013C 2685 nt2.36□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 RIM13YMR154C 2184 nt2.36□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 ERG28YER044C 447 nt2.36□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 YER046W-AYER046W-A 330 nt2.36□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 RSR1YGR152C 819 nt2.36□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.36□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 CTK2YJL006C 972 nt2.36□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 ERV41YML067C 1059 nt2.36□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 YNL089CYNL089C 477 nt2.36□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 PEX27YOR193W 1131 nt2.36□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 PET20YPL159C 762 nt2.36□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 ERT1YBR239C 1590 nt2.36□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 SLS1YLR139C 1932 nt2.35□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 HTB1YDR224C 396 nt2.35□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 PIB1YDR313C 861 nt2.35□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 POL32YJR043C 1053 nt2.35□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.35□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 NTC20YBR188C 423 nt2.35□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 SIR3YLR442C 2937 nt2.35□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.35□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 BRE5YNR051C 1548 nt2.35□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 VPS13YLL040C 9435 nt2.35□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 BIT61YJL058C 1632 nt2.35□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 MST28YAR033W 705 nt2.34□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 RPS30AYLR287C-A 192 nt2.34□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 KTI11YBL071W-A 249 nt2.34□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 NGL1YOL042W 1092 nt2.34□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.34□□□□□ -2.03
RRP42Q12277 YKR078WYKR078W 1758 nt2.33□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 YEF3YLR249W 3135 nt2.33□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 ORC2YBR060C 1863 nt2.33□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 SCD5YOR329C 2619 nt2.33□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 ATC1YDR184C 885 nt2.33□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 YGR293CYGR293C 462 nt2.33□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 YIL012WYIL012W 342 nt2.33□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 YLR050CYLR050C 486 nt2.33□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 YMR181CYMR181C 465 nt2.33□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 ATX1YNL259C 222 nt2.33□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 TMN3YER113C 2121 nt2.33□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 MSB1YOR188W 3414 nt2.33□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 YDR186CYDR186C 2634 nt2.33□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 FIR1YER032W 2631 nt2.33□□□□□ -2.04
RRP42Q12277 RLI1YDR091C 1827 nt2.33□□□□□ -2.04
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