Protein–RNA interactions for Protein: Q12048

ATG41, Autophagy-related protein 41, yeastyeast

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG41Q12048 TRM2YKR056W 1920 nt1.71□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 YNL018CYNL018C 1839 nt1.7□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 SCY1YGL083W 2415 nt1.7□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 VPS41YDR080W 2979 nt1.7□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 VEL1YGL258W 621 nt1.7□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt1.7□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 ESF2YNR054C 951 nt1.7□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 NUP170YBL079W 4509 nt1.7□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.69□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 TIM9YEL020W-A 264 nt1.69□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 SAY1YGR263C 1275 nt1.69□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 ASG7YJL170C 630 nt1.69□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 MSA2YKR077W 1092 nt1.69□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 ECM13YBL043W 774 nt1.69□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 GCY1YOR120W 939 nt1.69□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 MBA1YBR185C 837 nt1.69□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 SST2YLR452C 2097 nt1.69□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 KAP123YER110C 3342 nt1.68□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 NOP56YLR197W 1515 nt1.68□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 snR68snR68 136 nt1.68□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 MFA1YDR461W 111 nt1.68□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 EMI1YDR512C 564 nt1.68□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 SAE2YGL175C 1038 nt1.68□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 YAP5YIR018W 738 nt1.68□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 YKL162CYKL162C 1209 nt1.68□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 RPL6BYLR448W 531 nt1.68□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 HSC82YMR186W 2118 nt1.68□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 YPL142CYPL142C 318 nt1.68□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 RPL36BYPL249C-A 303 nt1.68□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 SPP381YBR152W 876 nt1.68□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 LDH1YBR204C 1128 nt1.68□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 RTP1YMR185W 2946 nt1.68□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 HOP1YIL072W 1818 nt1.68□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 SDC25YLL016W 3147 nt1.67□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 UBR2YLR024C 5619 nt1.67□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 RPL13AYDL082W 600 nt1.67□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 DIG2YDR480W 972 nt1.67□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 EDC1YGL222C 528 nt1.67□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 POP6YGR030C 477 nt1.67□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 ATP7YKL016C 525 nt1.67□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 BOS1YLR078C 735 nt1.67□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 YMR320WYMR320W 306 nt1.67□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 YNL046WYNL046W 519 nt1.67□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 EAF7YNL136W 1278 nt1.67□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 HMT1YBR034C 1047 nt1.67□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 ARK1YNL020C 1917 nt1.67□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 INP53YOR109W 3324 nt1.67□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 AI4Q0065 1671 nt1.67□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 ROY1YMR258C 1662 nt1.67□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 HOS4YIL112W 3252 nt1.67□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 KSP1YHR082C 3090 nt1.66□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 KEG1YFR042W 603 nt1.66□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 COG2YGR120C 789 nt1.66□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 YGR226CYGR226C 210 nt1.66□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 YHL044WYHL044W 708 nt1.66□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt1.66□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt1.66□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 YMR178WYMR178W 825 nt1.66□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 YMR181CYMR181C 465 nt1.66□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 RPL36AYMR194W 303 nt1.66□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 REG2YBR050C 1017 nt1.66□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 snR35snR35 204 nt1.66□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 MDM10YAL010C 1482 nt1.66□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 RTG3YBL103C 1461 nt1.66□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 RGA1YOR127W 3024 nt1.66□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 BUB1YGR188C 3066 nt1.65□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 APC2YLR127C 2562 nt1.65□□□□□ -2.14
ATG41Q12048 YFH1YDL120W 525 nt1.65□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 CBS2YDR197W 1170 nt1.65□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 CPR5YDR304C 678 nt1.65□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 MPO1YGL010W 525 nt1.65□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 YLR257WYLR257W 966 nt1.65□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 TAF4YMR005W 1167 nt1.65□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 YMR099CYMR099C 894 nt1.65□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 AFI1YOR129C 2682 nt1.65□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 SLF1YDR515W 1344 nt1.65□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 SSY1YDR160W 2559 nt1.64□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 YCT1YLL055W 1596 nt1.64□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 RSM24YDR175C 960 nt1.64□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 YFH7YFR007W 1062 nt1.64□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 MIG2YGL209W 1149 nt1.64□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 YOR277CYOR277C 309 nt1.64□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 CDC5YMR001C 2118 nt1.63□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 GYP5YPL249C 2685 nt1.63□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 TWF1YGR080W 999 nt1.63□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 YHR212CYHR212C 336 nt1.63□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt1.63□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 YJL202CYJL202C 348 nt1.63□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 NNF1YJR112W 606 nt1.63□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 YAR060CYAR060C 336 nt1.63□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 ARC18YLR370C 537 nt1.63□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 YML094C-AYML094C-A 402 nt1.63□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 SPO20YMR017W 1194 nt1.63□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 RUF20RUF20 443 nt1.63□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 NGL1YOL042W 1092 nt1.63□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 CRS5YOR031W 210 nt1.63□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 ARR2YPR200C 393 nt1.63□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 RGL1YPL066W 1440 nt1.63□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 INP51YIL002C 2841 nt1.62□□□□□ -2.15
ATG41Q12048 ALY1YKR021W 2748 nt1.62□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 55.2 ms