Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1Q01196 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms