Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	ERG25	YGR060W	930 nt		2.4	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	MCR1	YKL150W	909 nt		2.4	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	REC102	YLR329W	795 nt		2.4	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	YML094C-A	YML094C-A	402 nt		2.4	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	MED8	YBR193C	672 nt		2.4	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	YNL193W	YNL193W	1677 nt		2.4	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	STI1	YOR027W	1770 nt		2.39	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	JSN1	YJR091C	3276 nt		2.39	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	HPA3	YEL066W	540 nt		2.39	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	LSM4	YER112W	564 nt		2.39	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	VMA10	YHR039C-A	345 nt		2.39	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	DSE2	YHR143W	978 nt		2.39	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	YHR212C	YHR212C	336 nt		2.39	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	SRL3	YKR091W	741 nt		2.39	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	YAL064W	YAL064W	285 nt		2.39	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	YAR060C	YAR060C	336 nt		2.39	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	YLR365W	YLR365W	333 nt		2.39	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	SAS2	YMR127C	1017 nt		2.39	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	YBL055C	YBL055C	1257 nt		2.39	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	MER1	YNL210W	813 nt		2.39	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	YNL276C	YNL276C	396 nt		2.39	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	snR35	snR35	204 nt		2.39	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	APA1	YCL050C	966 nt		2.39	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	PUT3	YKL015W	2940 nt		2.39	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	ART10	YLR392C	1557 nt		2.39	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	YDR170W-A	YDR170W-A	1323 nt		2.39	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	YBL005W-A	YBL005W-A	1323 nt		2.39	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	YMR046C	YMR046C	1323 nt		2.39	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	YNL284C-A	YNL284C-A	1323 nt		2.39	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	ICR1	ICR1	3199 nt		2.39	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	YCR064C	YCR064C	411 nt		2.38	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	SEC4	YFL005W	648 nt		2.38	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	COG7	YGL005C	840 nt		2.38	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	RSR1	YGR152C	819 nt		2.38	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	COX3	Q0275	810 nt		2.38	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	SUI2	YJR007W	915 nt		2.38	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	AIM32	YML050W	936 nt		2.38	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	ADI1	YMR009W	540 nt		2.38	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	ATP11	YNL315C	957 nt		2.38	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	snR44	snR44	211 nt		2.38	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	TOR1	YJR066W	7413 nt		2.38	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	TFB1	YDR311W	1929 nt		2.38	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	SLS1	YLR139C	1932 nt		2.38	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	NRG1	YDR043C	696 nt		2.37	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	CPR5	YDR304C	678 nt		2.37	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	CWC23	YGL128C	852 nt		2.37	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	YGL204C	YGL204C	306 nt		2.37	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	SFT1	YKL006C-A	294 nt		2.37	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	YBL029C-A	YBL029C-A	285 nt		2.37	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	ICY1	YMR195W	384 nt		2.37	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	SSY1	YDR160W	2559 nt		2.37	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	YOL057W	YOL057W	2136 nt		2.36	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	SEN54	YPL083C	1404 nt		2.36	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	ATG11	YPR049C	3537 nt		2.36	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	BIT61	YJL058C	1632 nt		2.36	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	EMI1	YDR512C	564 nt		2.36	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	BAT1	YHR208W	1182 nt		2.36	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	YIL141W	YIL141W	390 nt		2.36	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	YKL131W	YKL131W	522 nt		2.36	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	SPC2	YML055W	537 nt		2.36	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	HAT1	YPL001W	1125 nt		2.36	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	SLM4	YBR077C	489 nt		2.36	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	CWC22	YGR278W	1734 nt		2.36	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	TRM82	YDR165W	1335 nt		2.36	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	DNL4	YOR005C	2835 nt		2.35	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	INP53	YOR109W	3324 nt		2.35	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	SAP190	YKR028W	3102 nt		2.35	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	HLR1	YDR528W	1272 nt		2.35	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	PRE4	YFR050C	801 nt		2.35	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	VEL1	YGL258W	621 nt		2.35	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	YIR021W-A	YIR021W-A	213 nt		2.35	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	YJL114W	YJL114W	681 nt		2.35	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	AIM36	YMR157C	768 nt		2.35	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	YMR194C-A	YMR194C-A	225 nt		2.35	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	YNL226W	YNL226W	411 nt		2.35	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	YPL142C	YPL142C	318 nt		2.35	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	NOP56	YLR197W	1515 nt		2.35	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	SEC16	YPL085W	6588 nt		2.35	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	SPF1	YEL031W	3648 nt		2.35	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	HSE1	YHL002W	1359 nt		2.35	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	JJJ2	YJL162C	1752 nt		2.34	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	TVP15	YDR100W	432 nt		2.34	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	FIN1	YDR130C	876 nt		2.34	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	YGL117W	YGL117W	798 nt		2.34	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	MIG2	YGL209W	1149 nt		2.34	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	GTR2	YGR163W	1026 nt		2.34	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	SEC28	YIL076W	891 nt		2.34	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	YAL066W	YAL066W	309 nt		2.34	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	SRT1	YMR101C	1032 nt		2.34	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	MRPL17	YNL252C	846 nt		2.34	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	SFG1	YOR315W	1041 nt		2.34	□□□□□ -2.03
ATG12	P38316	PIG2	YIL045W	1617 nt		2.34	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	YBP2	YGL060W	1926 nt		2.34	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	ARK1	YNL020C	1917 nt		2.34	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	GCD10	YNL062C	1437 nt		2.34	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	SSN2	YDR443C	4263 nt		2.33	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	AEP1	YMR064W	1557 nt		2.33	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	POM152	YMR129W	4014 nt		2.33	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	DUG2	YBR281C	2637 nt		2.33	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	YGR111W	YGR111W	1203 nt		2.33	□□□□□ -2.04

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.3 ms