Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RXRAP19793 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RXRAP19793 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RXRAP19793 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RXRAP19793 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RXRAP19793 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RXRAP19793 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RXRAP19793 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RXRAP19793 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RXRAP19793 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RXRAP19793 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RXRAP19793 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RXRAP19793 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RXRAP19793 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RXRAP19793 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RXRAP19793 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RXRAP19793 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RXRAP19793 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RXRAP19793 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RXRAP19793 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RXRAP19793 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RXRAP19793 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RXRAP19793 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RXRAP19793 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RXRAP19793 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RXRAP19793 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RXRAP19793 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RXRAP19793 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RXRAP19793 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RXRAP19793 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RXRAP19793 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RXRAP19793 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RXRAP19793 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RXRAP19793 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RXRAP19793 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RXRAP19793 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RXRAP19793 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RXRAP19793 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RXRAP19793 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RXRAP19793 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RXRAP19793 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RXRAP19793 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RXRAP19793 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RXRAP19793 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RXRAP19793 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RXRAP19793 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RXRAP19793 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RXRAP19793 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RXRAP19793 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RXRAP19793 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RXRAP19793 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RXRAP19793 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RXRAP19793 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RXRAP19793 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RXRAP19793 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RXRAP19793 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RXRAP19793 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RXRAP19793 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RXRAP19793 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RXRAP19793 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RXRAP19793 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RXRAP19793 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RXRAP19793 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RXRAP19793 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RXRAP19793 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RXRAP19793 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RXRAP19793 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RXRAP19793 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RXRAP19793 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RXRAP19793 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RXRAP19793 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RXRAP19793 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RXRAP19793 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RXRAP19793 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RXRAP19793 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RXRAP19793 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RXRAP19793 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RXRAP19793 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RXRAP19793 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RXRAP19793 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RXRAP19793 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RXRAP19793 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RXRAP19793 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RXRAP19793 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RXRAP19793 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RXRAP19793 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RXRAP19793 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RXRAP19793 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RXRAP19793 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RXRAP19793 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RXRAP19793 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RXRAP19793 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RXRAP19793 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RXRAP19793 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RXRAP19793 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RXRAP19793 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RXRAP19793 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RXRAP19793 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RXRAP19793 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RXRAP19793 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms