Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 HSPA9-209ENST00000507886 551 ntTSL 310.32□□□□□ -0.767e-6■□□□□ 8.7
UTP3Q9NQZ2 PNISR-207ENST00000478777 2422 ntTSL 29.93□□□□□ -0.827e-6■□□□□ 8.7
UTP3Q9NQZ2 HSF4-219ENST00000522027 447 ntTSL 39.85□□□□□ -0.837e-6■□□□□ 8.7
UTP3Q9NQZ2 PNISR-204ENST00000463021 1939 ntTSL 1 (best)6.64□□□□□ -1.357e-6■□□□□ 8.7
UTP3Q9NQZ2 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.397e-6■□□□□ 8.7
UTP3Q9NQZ2 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.627e-6■□□□□ 8.7
UTP3Q9NQZ2 ANP32E-204ENST00000532744 621 ntTSL 317.18■□□□□ 0.349e-13■□□□□ 8.5
UTP3Q9NQZ2 ANP32E-206ENST00000534220 512 ntTSL 59.77□□□□□ -0.859e-13■□□□□ 8.5
UTP3Q9NQZ2 CSNK2B-205ENST00000465481 579 ntTSL 1 (best)15.37■□□□□ 0.058e-9■□□□□ 8.5
UTP3Q9NQZ2 CSNK2B-207ENST00000475875 590 ntTSL 1 (best)15.37■□□□□ 0.058e-9■□□□□ 8.5
UTP3Q9NQZ2 GSTP1-206ENST00000495996 221 ntTSL 29.69□□□□□ -0.863e-9■□□□□ 8.5
UTP3Q9NQZ2 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3.96□□□□□ -1.782e-59■□□□□ 8.5
UTP3Q9NQZ2 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.741e-9■□□□□ 8.4
UTP3Q9NQZ2 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC7.13□□□□□ -1.271e-9■□□□□ 8.4
UTP3Q9NQZ2 PTCD3-216ENST00000487043 1054 ntTSL 36.48□□□□□ -1.371e-9■□□□□ 8.4
UTP3Q9NQZ2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.223e-6■□□□□ 8.4
UTP3Q9NQZ2 PCMT1-209ENST00000494411 600 ntTSL 420.39■□□□□ 0.853e-6■□□□□ 8.4
UTP3Q9NQZ2 PCMT1-207ENST00000484601 1095 ntTSL 519.11■□□□□ 0.653e-6■□□□□ 8.4
UTP3Q9NQZ2 PCMT1-204ENST00000460828 582 ntTSL 517.89■□□□□ 0.453e-6■□□□□ 8.4
UTP3Q9NQZ2 PCMT1-208ENST00000486585 801 ntTSL 310.44□□□□□ -0.743e-6■□□□□ 8.4
UTP3Q9NQZ2 SNORD15A-201ENST00000384214 148 ntBASIC7.95□□□□□ -1.141e-8■□□□□ 8.3
UTP3Q9NQZ2 ALDOA-214ENST00000564688 613 ntTSL 512.4□□□□□ -0.423e-14■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 FAM118A-209ENST00000476478 354 ntTSL 311.9□□□□□ -0.51e-5■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 LDHA-216ENST00000538451 1345 ntTSL 210.79□□□□□ -0.684e-9■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RPL4-216ENST00000569438 565 ntTSL 515.16■□□□□ 0.025e-6■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RPL4-212ENST00000566622 817 ntTSL 214.49□□□□□ -0.095e-6■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RPL4-211ENST00000566491 593 ntTSL 213.59□□□□□ -0.235e-6■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RPL4-214ENST00000567229 2003 ntTSL 512.75□□□□□ -0.375e-6■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RPL4-215ENST00000568588 1864 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.55e-6■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RPL4-201ENST00000307961 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.555e-6■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RPL4-202ENST00000561554 580 ntTSL 411.5□□□□□ -0.575e-6■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RPL4-205ENST00000564439 582 ntTSL 311.46□□□□□ -0.575e-6■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RPL4-213ENST00000566624 819 ntTSL 211.27□□□□□ -0.615e-6■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RPL4-217ENST00000569696 569 ntTSL 511.27□□□□□ -0.615e-6■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RPL4-210ENST00000566039 1099 ntTSL 29.33□□□□□ -0.925e-6■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RPL4-203ENST00000561775 1396 ntTSL 58.31□□□□□ -1.085e-6■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 TRIM28-211ENST00000597968 504 ntTSL 214.39□□□□□ -0.111e-9■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.784e-8■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RPL35A-203ENST00000439255 564 ntTSL 57.39□□□□□ -1.234e-12■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RPL35A-204ENST00000442341 517 ntTSL 35.89□□□□□ -1.474e-12■□□□□ 8.2
UTP3Q9NQZ2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.361e-6■□□□□ 8.1
UTP3Q9NQZ2 RBM39-215ENST00000442447 644 ntTSL 217.28■□□□□ 0.361e-6■□□□□ 8.1
UTP3Q9NQZ2 RBM39-219ENST00000453310 1068 ntTSL 216.82■□□□□ 0.281e-6■□□□□ 8.1
UTP3Q9NQZ2 RBM39-213ENST00000433027 611 ntTSL 516.38■□□□□ 0.211e-6■□□□□ 8.1
UTP3Q9NQZ2 RBM39-209ENST00000416529 594 ntTSL 38.01□□□□□ -1.131e-6■□□□□ 8.1
UTP3Q9NQZ2 RBM39-218ENST00000449489 432 ntTSL 57.98□□□□□ -1.131e-6■□□□□ 8.1
UTP3Q9NQZ2 RBM39-234ENST00000487604 370 ntTSL 37.84□□□□□ -1.151e-6■□□□□ 8.1
UTP3Q9NQZ2 RBM39-211ENST00000426951 840 ntTSL 1 (best)7.81□□□□□ -1.161e-6■□□□□ 8.1
UTP3Q9NQZ2 RBM39-231ENST00000477334 949 ntTSL 27.81□□□□□ -1.161e-6■□□□□ 8.1
UTP3Q9NQZ2 NOP58-203ENST00000433543 714 ntTSL 38.98□□□□□ -0.972e-15■□□□□ 8
UTP3Q9NQZ2 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC4.15□□□□□ -1.752e-15■□□□□ 8
UTP3Q9NQZ2 CD63-203ENST00000546457 607 ntTSL 214.9□□□□□ -0.024e-6■□□□□ 8
UTP3Q9NQZ2 UBA2-206ENST00000591016 646 ntTSL 24.09□□□□□ -1.754e-6■□□□□ 8
Retrieved 53 of 52,753 protein–RNA pairs in 2959.1 ms