Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLF12Q9Y4X4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms