Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM106CQ9BVX2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms