Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CSPG4P5Q96PW8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSPG4P5Q96PW8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms