Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP13Q86W25 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP13Q86W25 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms