Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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EXT1Q16394 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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EXT1Q16394 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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EXT1Q16394 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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EXT1Q16394 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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EXT1Q16394 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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EXT1Q16394 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
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EXT1Q16394 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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EXT1Q16394 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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EXT1Q16394 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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EXT1Q16394 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXT1Q16394 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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EXT1Q16394 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
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EXT1Q16394 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
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EXT1Q16394 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXT1Q16394 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXT1Q16394 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXT1Q16394 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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EXT1Q16394 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXT1Q16394 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXT1Q16394 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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EXT1Q16394 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXT1Q16394 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXT1Q16394 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXT1Q16394 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXT1Q16394 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXT1Q16394 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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