Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 SPP382YLR424W 2127 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 ATX1YNL259C 222 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 SAC1YKL212W 1872 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 ASI1YMR119W 1875 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 YLL032CYLL032C 2478 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 ATG20YDL113C 1923 nt4.72□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 TUL1YKL034W 2277 nt4.71□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 DSL1YNL258C 2265 nt4.71□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 SCY1YGL083W 2415 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 YDL062WYDL062W 426 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 MFA1YDR461W 111 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 YGL052WYGL052W 306 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 TMA10YLR327C 261 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 DAL82YNL314W 768 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 YBR064WYBR064W 429 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 NPR2YEL062W 1848 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 MNT4YNR059W 1743 nt4.71□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 IMA1YGR287C 1770 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 GRS1YBR121C 2004 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 RAD61YDR014W 1944 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 VPS45YGL095C 1734 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 RIM15YFL033C 5313 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 RPC11YDR045C 333 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 PXR1YGR280C 816 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 snR13snR13 124 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 PSE1YMR308C 3270 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 YND1YER005W 1893 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 GSM1YJL103C 1857 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 PDI1YCL043C 1569 nt4.7□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 RSC6YCR052W 1452 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 DSF2YBR007C 2211 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 KIP2YPL155C 2121 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 YCR050CYCR050C 309 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 YLR140WYLR140W 327 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 snR10snR10 245 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 SRL1YOR247W 633 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 REI1YBR267W 1182 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 GLT1YDL171C 6438 nt4.69□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 NDC80YIL144W 2076 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 YDL228CYDL228C 642 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 YDR526CYDR526C 471 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 YFR056CYFR056C 369 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 RPS4BYHR203C 786 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 HHF2YNL030W 312 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 RPS7BYNL096C 573 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 YBL073WYBL073W 312 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 YBR197CYBR197C 654 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 OCA5YHL029C 2040 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 UTP13YLR222C 2454 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 APP1YNL094W 1764 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 snR55snR55 98 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 HTL1YCR020W-B 237 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 MIC19YFR011C 513 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 ISU2YOR226C 471 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 DIB1YPR082C 432 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 TOS3YGL179C 1683 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 MCH4YOL119C 1506 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 CTM1YHR109W 1758 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 UTP25YIL091C 2166 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 LPP1YDR503C 825 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 YEL067CYEL067C 588 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 YEL075CYEL075C 369 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 YER187WYER187W 426 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 YER189WYER189W 369 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 YRR1YOR162C 2433 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 TUP1YCR084C 2142 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 TAF7YMR227C 1773 nt4.65□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 YOR1YGR281W 4434 nt4.65□□□□□ -1.66
TY1A-BLQ12266 YEL014CYEL014C 306 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1A-BLQ12266 VEL1YGL258W 621 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1A-BLQ12266 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1A-BLQ12266 YAR068WYAR068W 486 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1A-BLQ12266 TVP18YMR071C 504 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1A-BLQ12266 SIP18YMR175W 240 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1A-BLQ12266 YBL053WYBL053W 375 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1A-BLQ12266 SSO1YPL232W 873 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1A-BLQ12266 SHQ1YIL104C 1524 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1A-BLQ12266 YTA12YMR089C 2478 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1A-BLQ12266 NUD1YOR373W 2556 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-BLQ12266 TPD3YAL016W 1908 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-BLQ12266 TAR1YLR154W-C 375 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-BLQ12266 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-BLQ12266 RDN58-1RDN58-1 158 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-BLQ12266 RDN58-2RDN58-2 158 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-BLQ12266 RPL21BYPL079W 483 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-BLQ12266 STE20YHL007C 2820 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-BLQ12266 STI1YOR027W 1770 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-BLQ12266 ATH1YPR026W 3636 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-BLQ12266 SCW4YGR279C 1161 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-BLQ12266 PET191YJR034W 327 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-BLQ12266 YPL238CYPL238C 390 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-BLQ12266 COX1Q0045 1605 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-BLQ12266 PHO8YDR481C 1701 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-BLQ12266 SED4YCR067C 3198 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-BLQ12266 RKM1YPL208W 1752 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-BLQ12266 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29 ms