Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms