Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
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COL24A1Q17RW2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
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COL24A1Q17RW2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
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COL24A1Q17RW2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
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COL24A1Q17RW2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
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COL24A1Q17RW2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
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COL24A1Q17RW2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
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COL24A1Q17RW2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
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COL24A1Q17RW2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
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COL24A1Q17RW2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL24A1Q17RW2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
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