Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME3Q16798 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME3Q16798 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME3Q16798 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ME3Q16798 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ME3Q16798 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ME3Q16798 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ME3Q16798 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ME3Q16798 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ME3Q16798 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ME3Q16798 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ME3Q16798 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ME3Q16798 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ME3Q16798 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ME3Q16798 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ME3Q16798 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ME3Q16798 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME3Q16798 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME3Q16798 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME3Q16798 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME3Q16798 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME3Q16798 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME3Q16798 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME3Q16798 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME3Q16798 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME3Q16798 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME3Q16798 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ME3Q16798 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME3Q16798 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME3Q16798 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME3Q16798 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME3Q16798 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME3Q16798 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ME3Q16798 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ME3Q16798 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ME3Q16798 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ME3Q16798 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ME3Q16798 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ME3Q16798 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ME3Q16798 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ME3Q16798 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ME3Q16798 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ME3Q16798 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ME3Q16798 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ME3Q16798 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ME3Q16798 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ME3Q16798 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ME3Q16798 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ME3Q16798 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME3Q16798 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME3Q16798 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME3Q16798 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME3Q16798 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME3Q16798 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME3Q16798 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME3Q16798 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ME3Q16798 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME3Q16798 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME3Q16798 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME3Q16798 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME3Q16798 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME3Q16798 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ME3Q16798 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ME3Q16798 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ME3Q16798 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ME3Q16798 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ME3Q16798 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ME3Q16798 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ME3Q16798 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ME3Q16798 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ME3Q16798 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ME3Q16798 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ME3Q16798 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ME3Q16798 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ME3Q16798 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ME3Q16798 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ME3Q16798 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ME3Q16798 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ME3Q16798 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ME3Q16798 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ME3Q16798 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ME3Q16798 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ME3Q16798 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ME3Q16798 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME3Q16798 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME3Q16798 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME3Q16798 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ME3Q16798 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME3Q16798 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME3Q16798 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME3Q16798 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME3Q16798 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME3Q16798 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
ME3Q16798 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ME3Q16798 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ME3Q16798 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ME3Q16798 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ME3Q16798 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ME3Q16798 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ME3Q16798 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
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