Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 SSP120YLR250W 705 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 YOR385WYOR385W 873 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 YPL142CYPL142C 318 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 snR32snR32 188 nt4.82□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 NTH2YBR001C 2343 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 SOF1YLL011W 1470 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 PAH1YMR165C 2589 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 PHO84YML123C 1764 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 FRE3YOR381W 2136 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 YDL034WYDL034W 345 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 YFH1YDL120W 525 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 COX26YDR119W-A 201 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 TRX2YGR209C 315 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 NSG1YHR133C 876 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 GPI14YJR013W 1212 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 PNP1YLR209C 936 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 YLR428CYLR428C 345 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 YPL229WYPL229W 621 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt4.81□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 MDM36YPR083W 1740 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 DED81YHR019C 1665 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 BIT2YBR270C 1638 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 RPP1AYDL081C 321 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 SPC19YDR201W 498 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 YFL015CYFL015C 495 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 YGR022CYGR022C 330 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 HSX1tR(CCU)J 72 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 YJL086CYJL086C 369 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 UBC4YBR082C 447 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 FPK1YNR047W 2682 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 BRF1YGR246C 1791 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 DAK1YML070W 1755 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 PMA1YGL008C 2757 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 MON1YGL124C 1935 nt4.8□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 NIC96YFR002W 2520 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 PRP28YDR243C 1767 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 OTU1YFL044C 906 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 RPL26AYLR344W 384 nt4.79□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 PEX30YLR324W 1572 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 YFL034WYFL034W 3222 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 TDA11YHR159W 1515 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 SYG1YIL047C 2709 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 CTT1YGR088W 1689 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 YFL064CYFL064C 525 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 YGL088WYGL088W 366 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 YAR070CYAR070C 300 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 YPR195CYPR195C 330 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 IMD3YLR432W 1572 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 TRF5YNL299W 1929 nt4.78□□□□□ -1.64
TY1A-BLQ12266 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 RPS16BYDL083C 432 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 OPI6YDL096C 327 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 NIT2YJL126W 924 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 HSK3YKL138C-A 210 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 YKE2YLR200W 345 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 RPC40YPR110C 1008 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 MNN1YER001W 2289 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 HRK1YOR267C 2280 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 CYK3YDL117W 2658 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 GEP3YOR205C 1671 nt4.77□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 PHO90YJL198W 2646 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 PPR1YLR014C 2715 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 ELP2YGR200C 2367 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 TIF35YDR429C 825 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 CNB1YKL190W 528 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 RPL15AYLR029C 615 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 IRC23YOR044W 474 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 PCK1YKR097W 1650 nt4.76□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 HXT14YNL318C 1623 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 SUR2YDR297W 1050 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 UTR4YEL038W 684 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 YHL026CYHL026C 948 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 TMC1YOR052C 453 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 SLK19YOR195W 2466 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 VIK1YPL253C 1944 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 YOR022CYOR022C 2148 nt4.75□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 MCX1YBR227C 1563 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 CTS1YLR286C 1689 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 ARX1YDR101C 1782 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 MVP1YMR004W 1536 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 TDA5YLR426W 981 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 IST1YNL265C 897 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 IMD4YML056C 1575 nt4.74□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 OSW7YFR039C 1533 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 IRC4YDR540C 540 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 YFR054CYFR054C 579 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 ALG13YGL047W 609 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 NOP19YGR251W 591 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 YLR076CYLR076C 423 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 URA10YMR271C 684 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 DBF4YDR052C 2115 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 EXO1YOR033C 2109 nt4.73□□□□□ -1.65
TY1A-BLQ12266 DBF20YPR111W 1695 nt4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 58.7 ms