Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 CPR5YDR304C 678 nt3.02□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 VMA10YHR039C-A 345 nt3.02□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 IKI1YHR187W 930 nt3.02□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 YJL032WYJL032W 315 nt3.02□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 COX14YML129C 213 nt3.02□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt3.02□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 NGG1YDR176W 2109 nt3.02□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 GCD6YDR211W 2139 nt3.02□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 MAK5YBR142W 2322 nt3.02□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 CWH41YGL027C 2502 nt3.01□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 FLO1YAR050W 4614 nt3.01□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 YPR1YDR368W 939 nt3.01□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 EMI1YDR512C 564 nt3.01□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 VEL1YGL258W 621 nt3.01□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt3.01□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 YKL115CYKL115C 393 nt3.01□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 RPL6AYML073C 531 nt3.01□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 YNL319WYNL319W 441 nt3.01□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 YPR050CYPR050C 414 nt3.01□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 ARL1YBR164C 552 nt3.01□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 MET5YJR137C 4329 nt3.01□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 EAP1YKL204W 1899 nt3.01□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 GTR2YGR163W 1026 nt3□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 SEC14YMR079W 915 nt3□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 END3YNL084C 1050 nt3□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 THI80YOR143C 960 nt3□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 SOK1YDR006C 2706 nt3□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 YBR259WYBR259W 2067 nt3□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 CST9YLR394W 1449 nt3□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 PMR1YGL167C 2853 nt2.99□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 NSA2YER126C 786 nt2.99□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt2.99□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 YIL141WYIL141W 390 nt2.99□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 RPC25YKL144C 639 nt2.99□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 SMD2YLR275W 333 nt2.99□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 MPD2YOL088C 834 nt2.99□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 HUA2YOR284W 732 nt2.99□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 RPL20BYOR312C 519 nt2.99□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 CIN2YPL241C 807 nt2.99□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 SLM4YBR077C 489 nt2.99□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 snR24snR24 89 nt2.99□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 SRC1YML034W 2505 nt2.99□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 CCT7YJL111W 1653 nt2.98□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.98□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 KHA1YJL094C 2622 nt2.98□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 FUN30YAL019W 3396 nt2.98□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 AST2YER101C 1293 nt2.98□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 YFR054CYFR054C 579 nt2.98□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt2.98□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 YJL169WYJL169W 369 nt2.98□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.98□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 MRPL38YKL170W 417 nt2.98□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 SRL3YKR091W 741 nt2.98□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 PEX27YOR193W 1131 nt2.98□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 SWD3YBR175W 948 nt2.98□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 MED1YPR070W 1701 nt2.98□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 SPO14YKR031C 5052 nt2.97□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 RPA190YOR341W 4995 nt2.97□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 YPL216WYPL216W 3309 nt2.97□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 CBP2YHL038C 1893 nt2.97□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 SRD1YCR018C 666 nt2.97□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 CWC23YGL128C 852 nt2.97□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 PEF1YGR058W 1008 nt2.97□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 ATG27YJL178C 816 nt2.97□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 NDL1YLR254C 570 nt2.97□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 REC102YLR329W 795 nt2.97□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 YPL142CYPL142C 318 nt2.97□□□□□ -1.93
VPS54Q12071 DSE2YHR143W 978 nt2.96□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 ATG10YLL042C 504 nt2.96□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 YPT6YLR262C 648 nt2.96□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 YOR277CYOR277C 309 nt2.96□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 AIM4YBR194W 372 nt2.96□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 YBR300CYBR300C 498 nt2.96□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 BUD4YJR092W 4344 nt2.96□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 ITC1YGL133W 3795 nt2.96□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 FRE2YKL220C 2136 nt2.96□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 DBP7YKR024C 2229 nt2.96□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 NET1YJL076W 3570 nt2.96□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 STN1YDR082W 1485 nt2.96□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt2.95□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 RSN1YMR266W 2862 nt2.95□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 ORC1YML065W 2745 nt2.95□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 DSE4YNR067C 3354 nt2.95□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 YCK2YNL154C 1641 nt2.95□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 RSM24YDR175C 960 nt2.95□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt2.95□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 HLR1YDR528W 1272 nt2.95□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 ERP6YGL002W 651 nt2.95□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 YGR018CYGR018C 330 nt2.95□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 LSM8YJR022W 330 nt2.95□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 YKL069WYKL069W 543 nt2.95□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 MGE1YOR232W 687 nt2.95□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 RXT2YBR095C 1293 nt2.95□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 VAC8YEL013W 1737 nt2.95□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 SKO1YNL167C 1944 nt2.95□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 SLH1YGR271W 5904 nt2.95□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 INP52YNL106C 3552 nt2.95□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 VPS38YLR360W 1320 nt2.94□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 YLR446WYLR446W 1302 nt2.94□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 AVT2YEL064C 1443 nt2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 50.3 ms