Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms