Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms