Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDKN3Q16667 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CDKN3Q16667 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDKN3Q16667 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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