Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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