Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 YPL216WYPL216W 3309 nt2.49□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 POL4YCR014C 1749 nt2.49□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt2.49□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 YKL066WYKL066W 444 nt2.49□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 GAB1YLR459W 1185 nt2.49□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 CAT5YOR125C 702 nt2.49□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 YDR131CYDR131C 1671 nt2.49□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 PEX6YNL329C 3093 nt2.49□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 AVT2YEL064C 1443 nt2.49□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 ISW1YBR245C 3390 nt2.49□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 YNL011CYNL011C 1335 nt2.48□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 YNR066CYNR066C 1311 nt2.48□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 URB2YJR041C 3525 nt2.48□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 PFF1YBR074W 2931 nt2.48□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 snR68snR68 136 nt2.48□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 SNU23YDL098C 585 nt2.48□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt2.48□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 MBB1YJL199C 327 nt2.48□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 MET14YKL001C 609 nt2.48□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt2.48□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 ATG16YMR159C 453 nt2.48□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 DPB3YBR278W 606 nt2.48□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 HAA1YPR008W 2085 nt2.48□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 BOI1YBL085W 2943 nt2.48□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 BCK1YJL095W 4437 nt2.48□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 ICR1ICR1 3199 nt2.47□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 KHA1YJL094C 2622 nt2.47□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 STN1YDR082W 1485 nt2.47□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 FMN1YDR236C 657 nt2.47□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 YDR336WYDR336W 945 nt2.47□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 SPT15YER148W 723 nt2.47□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 PFS1YHR185C 714 nt2.47□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 CDC123YLR215C 1083 nt2.47□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 RRD2YPL152W 1077 nt2.47□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 SRO77YBL106C 3033 nt2.47□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 KEL2YGR238C 2649 nt2.47□□□□□ -2.01
SNF8Q12483 SSN2YDR443C 4263 nt2.46□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 HYP2YEL034W 474 nt2.46□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 YJR056CYJR056C 711 nt2.46□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 MCR1YKL150W 909 nt2.46□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 LCL1YPL056C 306 nt2.46□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 PEX5YDR244W 1839 nt2.46□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 DBP10YDL031W 2988 nt2.46□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 SGM1YJR134C 2124 nt2.45□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 CDC5YMR001C 2118 nt2.45□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 ARP9YMR033W 1404 nt2.45□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 YGR168CYGR168C 1131 nt2.45□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 YJL169WYJL169W 369 nt2.45□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 YKL070WYKL070W 510 nt2.45□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 PRM6YML047C 1059 nt2.45□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 RRG7YOR305W 729 nt2.45□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 YOR331CYOR331C 558 nt2.45□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 ACM1YPL267W 630 nt2.45□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 YPL276WYPL276W 438 nt2.45□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 AIM4YBR194W 372 nt2.45□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 FLO11YIR019C 4104 nt2.45□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 YOL057WYOL057W 2136 nt2.45□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 SEC26YDR238C 2922 nt2.45□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 SIR3YLR442C 2937 nt2.45□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 VPS64YDR200C 1815 nt2.45□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.44□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 SAD1YFR005C 1347 nt2.44□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 TDA10YGR205W 873 nt2.44□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 RNR2YJL026W 1200 nt2.44□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 RCE1YMR274C 948 nt2.44□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 HSP10YOR020C 321 nt2.44□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 GRX7YBR014C 612 nt2.44□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 PIS1YPR113W 663 nt2.44□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 RRG8YPR116W 834 nt2.44□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 PBP2YBR233W 1242 nt2.44□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 DUG2YBR281C 2637 nt2.44□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 VHR1YIL056W 1923 nt2.44□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 RTT10YPL183C 3042 nt2.44□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 RPO41YFL036W 4056 nt2.43□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 SUL1YBR294W 2580 nt2.43□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 DIG2YDR480W 972 nt2.43□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 PPE1YHR075C 1203 nt2.43□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.43□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.43□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.43□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.43□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.43□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.43□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 SYS1YJL004C 612 nt2.43□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 RPL23AYBL087C 414 nt2.43□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 MPP6YNR024W 561 nt2.43□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 TSR4YOL022C 1227 nt2.43□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 YOL118CYOL118C 309 nt2.43□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 ERV15YBR210W 429 nt2.43□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 ESC1YMR219W 4977 nt2.43□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 SEN54YPL083C 1404 nt2.42□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 TOP2YNL088W 4287 nt2.42□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 IKI3YLR384C 4050 nt2.42□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 RSE1YML049C 4086 nt2.42□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 MFA1YDR461W 111 nt2.42□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 HLR1YDR528W 1272 nt2.42□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 YGL218WYGL218W 651 nt2.42□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 YGR017WYGR017W 894 nt2.42□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.42□□□□□ -2.02
SNF8Q12483 PRE8YML092C 753 nt2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.6 ms