Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIRE1Q08AE8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms