Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ABCE1P61221 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ABCE1P61221 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms