Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 YGR107WYGR107W 450 nt2.52□□□□□ -2.01
DDI1P40087 PPE1YHR075C 1203 nt2.52□□□□□ -2.01
DDI1P40087 YKL070WYKL070W 510 nt2.52□□□□□ -2.01
DDI1P40087 ATG16YMR159C 453 nt2.52□□□□□ -2.01
DDI1P40087 TSR4YOL022C 1227 nt2.52□□□□□ -2.01
DDI1P40087 YOL118CYOL118C 309 nt2.52□□□□□ -2.01
DDI1P40087 GRX7YBR014C 612 nt2.52□□□□□ -2.01
DDI1P40087 TIM12YBR091C 330 nt2.52□□□□□ -2.01
DDI1P40087 SEC26YDR238C 2922 nt2.52□□□□□ -2.01
DDI1P40087 TRA1YHR099W 11235 nt2.52□□□□□ -2.01
DDI1P40087 RPO41YFL036W 4056 nt2.52□□□□□ -2.01
DDI1P40087 AVT2YEL064C 1443 nt2.51□□□□□ -2.01
DDI1P40087 MAK5YBR142W 2322 nt2.51□□□□□ -2.01
DDI1P40087 HMO1YDR174W 741 nt2.51□□□□□ -2.01
DDI1P40087 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.51□□□□□ -2.01
DDI1P40087 SPT15YER148W 723 nt2.51□□□□□ -2.01
DDI1P40087 KTI11YBL071W-A 249 nt2.51□□□□□ -2.01
DDI1P40087 RRG7YOR305W 729 nt2.51□□□□□ -2.01
DDI1P40087 MRD1YPR112C 2664 nt2.51□□□□□ -2.01
DDI1P40087 GIN4YDR507C 3429 nt2.51□□□□□ -2.01
DDI1P40087 NAB3YPL190C 2409 nt2.5□□□□□ -2.01
DDI1P40087 NUM1YDR150W 8247 nt2.5□□□□□ -2.01
DDI1P40087 YDL032WYDL032W 312 nt2.5□□□□□ -2.01
DDI1P40087 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.5□□□□□ -2.01
DDI1P40087 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.5□□□□□ -2.01
DDI1P40087 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.5□□□□□ -2.01
DDI1P40087 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.5□□□□□ -2.01
DDI1P40087 HLR1YDR528W 1272 nt2.5□□□□□ -2.01
DDI1P40087 HPA3YEL066W 540 nt2.5□□□□□ -2.01
DDI1P40087 MST27YGL051W 705 nt2.5□□□□□ -2.01
DDI1P40087 NNF1YJR112W 606 nt2.5□□□□□ -2.01
DDI1P40087 MCR1YKL150W 909 nt2.5□□□□□ -2.01
DDI1P40087 CDC123YLR215C 1083 nt2.5□□□□□ -2.01
DDI1P40087 PRM6YML047C 1059 nt2.5□□□□□ -2.01
DDI1P40087 YMR099CYMR099C 894 nt2.5□□□□□ -2.01
DDI1P40087 MIC27YNL100W 705 nt2.5□□□□□ -2.01
DDI1P40087 PDR17YNL264C 1053 nt2.5□□□□□ -2.01
DDI1P40087 PEX15YOL044W 1152 nt2.5□□□□□ -2.01
DDI1P40087 PEX6YNL329C 3093 nt2.5□□□□□ -2.01
DDI1P40087 MET6YER091C 2304 nt2.5□□□□□ -2.01
DDI1P40087 SWR1YDR334W 4545 nt2.49□□□□□ -2.01
DDI1P40087 snR68snR68 136 nt2.49□□□□□ -2.01
DDI1P40087 MRPL16YBL038W 699 nt2.49□□□□□ -2.01
DDI1P40087 ATP22YDR350C 2055 nt2.49□□□□□ -2.01
DDI1P40087 BOI1YBL085W 2943 nt2.48□□□□□ -2.01
DDI1P40087 YME2YMR302C 2553 nt2.48□□□□□ -2.01
DDI1P40087 RPL13AYDL082W 600 nt2.48□□□□□ -2.01
DDI1P40087 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.48□□□□□ -2.01
DDI1P40087 YJL169WYJL169W 369 nt2.48□□□□□ -2.01
DDI1P40087 RPL6BYLR448W 531 nt2.48□□□□□ -2.01
DDI1P40087 SAM37YMR060C 984 nt2.48□□□□□ -2.01
DDI1P40087 TPK2YPL203W 1143 nt2.48□□□□□ -2.01
DDI1P40087 GCD2YGR083C 1956 nt2.48□□□□□ -2.01
DDI1P40087 DSE1YER124C 1722 nt2.48□□□□□ -2.01
DDI1P40087 MUB1YMR100W 1863 nt2.48□□□□□ -2.01
DDI1P40087 PBS2YJL128C 2007 nt2.47□□□□□ -2.01
DDI1P40087 YGR293CYGR293C 462 nt2.47□□□□□ -2.01
DDI1P40087 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt2.47□□□□□ -2.01
DDI1P40087 JIP3YLR331C 378 nt2.47□□□□□ -2.01
DDI1P40087 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt2.47□□□□□ -2.01
DDI1P40087 GCY1YOR120W 939 nt2.47□□□□□ -2.01
DDI1P40087 ACM1YPL267W 630 nt2.47□□□□□ -2.01
DDI1P40087 SKP2YNL311C 2292 nt2.47□□□□□ -2.01
DDI1P40087 KHA1YJL094C 2622 nt2.46□□□□□ -2.02
DDI1P40087 CWC22YGR278W 1734 nt2.46□□□□□ -2.02
DDI1P40087 GCD10YNL062C 1437 nt2.46□□□□□ -2.02
DDI1P40087 YDR124WYDR124W 975 nt2.46□□□□□ -2.02
DDI1P40087 YFH7YFR007W 1062 nt2.46□□□□□ -2.02
DDI1P40087 ERP6YGL002W 651 nt2.46□□□□□ -2.02
DDI1P40087 SGM1YJR134C 2124 nt2.46□□□□□ -2.02
DDI1P40087 SRL3YKR091W 741 nt2.46□□□□□ -2.02
DDI1P40087 GSP1YLR293C 660 nt2.46□□□□□ -2.02
DDI1P40087 ADI1YMR009W 540 nt2.46□□□□□ -2.02
DDI1P40087 RPL23AYBL087C 414 nt2.46□□□□□ -2.02
DDI1P40087 snR35snR35 204 nt2.46□□□□□ -2.02
DDI1P40087 GEA1YJR031C 4227 nt2.46□□□□□ -2.02
DDI1P40087 IPI3YNL182C 1668 nt2.46□□□□□ -2.02
DDI1P40087 MLH1YMR167W 2310 nt2.46□□□□□ -2.02
DDI1P40087 YDR061WYDR061W 1620 nt2.46□□□□□ -2.02
DDI1P40087 YGL176CYGL176C 1665 nt2.45□□□□□ -2.02
DDI1P40087 DIG2YDR480W 972 nt2.45□□□□□ -2.02
DDI1P40087 RGI1YER067W 486 nt2.45□□□□□ -2.02
DDI1P40087 YGR168CYGR168C 1131 nt2.45□□□□□ -2.02
DDI1P40087 DSE2YHR143W 978 nt2.45□□□□□ -2.02
DDI1P40087 ERV41YML067C 1059 nt2.45□□□□□ -2.02
DDI1P40087 PNO1YOR145C 825 nt2.45□□□□□ -2.02
DDI1P40087 ATP3YBR039W 936 nt2.45□□□□□ -2.02
DDI1P40087 URB2YJR041C 3525 nt2.45□□□□□ -2.02
DDI1P40087 VPS13YLL040C 9435 nt2.44□□□□□ -2.02
DDI1P40087 UTP14YML093W 2700 nt2.44□□□□□ -2.02
DDI1P40087 IKI3YLR384C 4050 nt2.44□□□□□ -2.02
DDI1P40087 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt2.44□□□□□ -2.02
DDI1P40087 RPL17BYJL177W 555 nt2.44□□□□□ -2.02
DDI1P40087 DLT1YMR126C 1029 nt2.44□□□□□ -2.02
DDI1P40087 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.44□□□□□ -2.02
DDI1P40087 FMP41YNL168C 780 nt2.44□□□□□ -2.02
DDI1P40087 YNL276CYNL276C 396 nt2.44□□□□□ -2.02
DDI1P40087 INO4YOL108C 456 nt2.44□□□□□ -2.02
DDI1P40087 YBR292CYBR292C 372 nt2.44□□□□□ -2.02
DDI1P40087 SLP1YOR154W 1764 nt2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.2 ms