Protein–RNA interactions for Protein: P38915

SPT8, Transcription factor SPT8, yeastyeast

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT8P38915 PBP2YBR233W 1242 nt2.77□□□□□ -1.97
SPT8P38915 ISW1YBR245C 3390 nt2.77□□□□□ -1.97
SPT8P38915 BOI1YBL085W 2943 nt2.77□□□□□ -1.97
SPT8P38915 APC5YOR249C 2058 nt2.77□□□□□ -1.97
SPT8P38915 YBR259WYBR259W 2067 nt2.77□□□□□ -1.97
SPT8P38915 ARP8YOR141C 2646 nt2.76□□□□□ -1.97
SPT8P38915 IKI3YLR384C 4050 nt2.76□□□□□ -1.97
SPT8P38915 YJR056CYJR056C 711 nt2.76□□□□□ -1.97
SPT8P38915 YLR311CYLR311C 348 nt2.76□□□□□ -1.97
SPT8P38915 RPS1AYLR441C 768 nt2.76□□□□□ -1.97
SPT8P38915 ERV41YML067C 1059 nt2.76□□□□□ -1.97
SPT8P38915 RRD2YPL152W 1077 nt2.76□□□□□ -1.97
SPT8P38915 RLI1YDR091C 1827 nt2.76□□□□□ -1.97
SPT8P38915 YDR239CYDR239C 2364 nt2.76□□□□□ -1.97
SPT8P38915 FIR1YER032W 2631 nt2.76□□□□□ -1.97
SPT8P38915 SWR1YDR334W 4545 nt2.76□□□□□ -1.97
SPT8P38915 AI2Q0055 2565 nt2.76□□□□□ -1.97
SPT8P38915 HBT1YDL223C 3141 nt2.75□□□□□ -1.97
SPT8P38915 SSN2YDR443C 4263 nt2.75□□□□□ -1.97
SPT8P38915 TOP2YNL088W 4287 nt2.75□□□□□ -1.97
SPT8P38915 FKS3YMR306W 5358 nt2.75□□□□□ -1.97
SPT8P38915 SMY2YBR172C 2223 nt2.75□□□□□ -1.97
SPT8P38915 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.75□□□□□ -1.97
SPT8P38915 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt2.75□□□□□ -1.97
SPT8P38915 MIC27YNL100W 705 nt2.75□□□□□ -1.97
SPT8P38915 YOL114CYOL114C 609 nt2.75□□□□□ -1.97
SPT8P38915 YOR055WYOR055W 435 nt2.75□□□□□ -1.97
SPT8P38915 RPB8YOR224C 441 nt2.75□□□□□ -1.97
SPT8P38915 PIS1YPR113W 663 nt2.75□□□□□ -1.97
SPT8P38915 SPP381YBR152W 876 nt2.75□□□□□ -1.97
SPT8P38915 DUG2YBR281C 2637 nt2.75□□□□□ -1.97
SPT8P38915 AVT5YBL089W 1380 nt2.74□□□□□ -1.97
SPT8P38915 YOL057WYOL057W 2136 nt2.74□□□□□ -1.97
SPT8P38915 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.74□□□□□ -1.97
SPT8P38915 SPT15YER148W 723 nt2.74□□□□□ -1.97
SPT8P38915 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt2.74□□□□□ -1.97
SPT8P38915 YGR168CYGR168C 1131 nt2.74□□□□□ -1.97
SPT8P38915 PEX18YHR160C 852 nt2.74□□□□□ -1.97
SPT8P38915 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.74□□□□□ -1.97
SPT8P38915 KTI11YBL071W-A 249 nt2.74□□□□□ -1.97
SPT8P38915 YOR203WYOR203W 354 nt2.74□□□□□ -1.97
SPT8P38915 YPR142CYPR142C 564 nt2.74□□□□□ -1.97
SPT8P38915 GIN4YDR507C 3429 nt2.74□□□□□ -1.97
SPT8P38915 MLH1YMR167W 2310 nt2.74□□□□□ -1.97
SPT8P38915 YBT1YLL048C 4986 nt2.73□□□□□ -1.97
SPT8P38915 BUB1YGR188C 3066 nt2.73□□□□□ -1.97
SPT8P38915 PDR1YGL013C 3207 nt2.73□□□□□ -1.97
SPT8P38915 RPL35BYDL136W 363 nt2.73□□□□□ -1.97
SPT8P38915 ISC10YER180C 804 nt2.73□□□□□ -1.97
SPT8P38915 MPC3YGR243W 441 nt2.73□□□□□ -1.97
SPT8P38915 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt2.73□□□□□ -1.97
SPT8P38915 RPS10BYMR230W 318 nt2.73□□□□□ -1.97
SPT8P38915 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt2.73□□□□□ -1.97
SPT8P38915 SRL1YOR247W 633 nt2.73□□□□□ -1.97
SPT8P38915 ACM1YPL267W 630 nt2.73□□□□□ -1.97
SPT8P38915 RRG8YPR116W 834 nt2.73□□□□□ -1.97
SPT8P38915 SIR3YLR442C 2937 nt2.73□□□□□ -1.97
SPT8P38915 UTP15YMR093W 1542 nt2.73□□□□□ -1.97
SPT8P38915 UTP6YDR449C 1323 nt2.72□□□□□ -1.97
SPT8P38915 RRP14YKL082C 1305 nt2.72□□□□□ -1.97
SPT8P38915 PSP1YDR505C 2526 nt2.72□□□□□ -1.97
SPT8P38915 SOL3YHR163W 750 nt2.72□□□□□ -1.97
SPT8P38915 YLL047WYLL047W 384 nt2.72□□□□□ -1.97
SPT8P38915 NNT1YLR285W 786 nt2.72□□□□□ -1.97
SPT8P38915 YKU80YMR106C 1890 nt2.72□□□□□ -1.97
SPT8P38915 SEN54YPL083C 1404 nt2.72□□□□□ -1.97
SPT8P38915 AIM4YBR194W 372 nt2.72□□□□□ -1.97
SPT8P38915 WHI3YNL197C 1986 nt2.72□□□□□ -1.97
SPT8P38915 SGM1YJR134C 2124 nt2.71□□□□□ -1.98
SPT8P38915 TRA1YHR099W 11235 nt2.71□□□□□ -1.98
SPT8P38915 YDR290WYDR290W 330 nt2.71□□□□□ -1.98
SPT8P38915 TIM11YDR322C-A 291 nt2.71□□□□□ -1.98
SPT8P38915 TCA17YEL048C 459 nt2.71□□□□□ -1.98
SPT8P38915 COBQ0105 1158 nt2.71□□□□□ -1.98
SPT8P38915 RPS25AYGR027C 327 nt2.71□□□□□ -1.98
SPT8P38915 ERV1YGR029W 570 nt2.71□□□□□ -1.98
SPT8P38915 ARC19YKL013C 516 nt2.71□□□□□ -1.98
SPT8P38915 YOR050CYOR050C 348 nt2.71□□□□□ -1.98
SPT8P38915 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt2.7□□□□□ -1.98
SPT8P38915 MPS2YGL075C 1164 nt2.7□□□□□ -1.98
SPT8P38915 OTU2YHL013C 924 nt2.7□□□□□ -1.98
SPT8P38915 RGI2YIL057C 495 nt2.7□□□□□ -1.98
SPT8P38915 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.7□□□□□ -1.98
SPT8P38915 YLR365WYLR365W 333 nt2.7□□□□□ -1.98
SPT8P38915 YNL234WYNL234W 1281 nt2.7□□□□□ -1.98
SPT8P38915 TPT1YOL102C 693 nt2.7□□□□□ -1.98
SPT8P38915 FIG1YBR040W 897 nt2.7□□□□□ -1.98
SPT8P38915 PRM4YPL156C 855 nt2.7□□□□□ -1.98
SPT8P38915 GRX1YCL035C 333 nt2.7□□□□□ -1.98
SPT8P38915 SPF1YEL031W 3648 nt2.7□□□□□ -1.98
SPT8P38915 POL4YCR014C 1749 nt2.69□□□□□ -1.98
SPT8P38915 YDR250CYDR250C 276 nt2.69□□□□□ -1.98
SPT8P38915 KEG1YFR042W 603 nt2.69□□□□□ -1.98
SPT8P38915 YKL070WYKL070W 510 nt2.69□□□□□ -1.98
SPT8P38915 HOT13YKL084W 351 nt2.69□□□□□ -1.98
SPT8P38915 CWC24YLR323C 780 nt2.69□□□□□ -1.98
SPT8P38915 PRM6YML047C 1059 nt2.69□□□□□ -1.98
SPT8P38915 YBR209WYBR209W 318 nt2.69□□□□□ -1.98
SPT8P38915 ORC2YBR060C 1863 nt2.69□□□□□ -1.98
SPT8P38915 RRI1YDL216C 1323 nt2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 350.4 ms