Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Pbrm1Q8BSQ9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Pbrm1Q8BSQ9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Pbrm1Q8BSQ9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
Pbrm1Q8BSQ9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
Pbrm1Q8BSQ9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Pbrm1Q8BSQ9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Pbrm1Q8BSQ9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Pbrm1Q8BSQ9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Pbrm1Q8BSQ9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Pbrm1Q8BSQ9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Pbrm1Q8BSQ9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Pbrm1Q8BSQ9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
Pbrm1Q8BSQ9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Pbrm1Q8BSQ9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
Pbrm1Q8BSQ9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC40.96■■■■■ 4.15
Pbrm1Q8BSQ9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Pbrm1Q8BSQ9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Pbrm1Q8BSQ9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Pbrm1Q8BSQ9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Pbrm1Q8BSQ9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Pbrm1Q8BSQ9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Pbrm1Q8BSQ9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Pbrm1Q8BSQ9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Pbrm1Q8BSQ9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Pbrm1Q8BSQ9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Pbrm1Q8BSQ9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Pbrm1Q8BSQ9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Pbrm1Q8BSQ9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
Pbrm1Q8BSQ9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.12
Pbrm1Q8BSQ9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
Pbrm1Q8BSQ9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Pbrm1Q8BSQ9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
Pbrm1Q8BSQ9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
Pbrm1Q8BSQ9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Pbrm1Q8BSQ9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Pbrm1Q8BSQ9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Pbrm1Q8BSQ9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Pbrm1Q8BSQ9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Pbrm1Q8BSQ9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
Pbrm1Q8BSQ9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Pbrm1Q8BSQ9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
Pbrm1Q8BSQ9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
Pbrm1Q8BSQ9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Pbrm1Q8BSQ9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Pbrm1Q8BSQ9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
Pbrm1Q8BSQ9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC40.71■■■■■ 4.11
Pbrm1Q8BSQ9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC40.69■■■■■ 4.1
Pbrm1Q8BSQ9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Pbrm1Q8BSQ9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Pbrm1Q8BSQ9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Pbrm1Q8BSQ9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Pbrm1Q8BSQ9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Pbrm1Q8BSQ9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Pbrm1Q8BSQ9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
Pbrm1Q8BSQ9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
Pbrm1Q8BSQ9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
Pbrm1Q8BSQ9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC40.6■■■■■ 4.09
Pbrm1Q8BSQ9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Pbrm1Q8BSQ9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Pbrm1Q8BSQ9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Pbrm1Q8BSQ9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC40.57■■■■■ 4.09
Pbrm1Q8BSQ9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Pbrm1Q8BSQ9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.56■■■■■ 4.08
Pbrm1Q8BSQ9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Pbrm1Q8BSQ9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Pbrm1Q8BSQ9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Pbrm1Q8BSQ9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Pbrm1Q8BSQ9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Pbrm1Q8BSQ9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Pbrm1Q8BSQ9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Pbrm1Q8BSQ9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
Pbrm1Q8BSQ9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC40.49■■■■■ 4.07
Pbrm1Q8BSQ9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Pbrm1Q8BSQ9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Pbrm1Q8BSQ9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Pbrm1Q8BSQ9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
Pbrm1Q8BSQ9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Pbrm1Q8BSQ9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Pbrm1Q8BSQ9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Pbrm1Q8BSQ9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Pbrm1Q8BSQ9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Pbrm1Q8BSQ9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
Pbrm1Q8BSQ9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
Pbrm1Q8BSQ9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Pbrm1Q8BSQ9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Pbrm1Q8BSQ9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Pbrm1Q8BSQ9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
Pbrm1Q8BSQ9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Pbrm1Q8BSQ9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Pbrm1Q8BSQ9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Pbrm1Q8BSQ9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Pbrm1Q8BSQ9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
Pbrm1Q8BSQ9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Pbrm1Q8BSQ9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Pbrm1Q8BSQ9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Pbrm1Q8BSQ9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms