Protein–RNA interactions for Protein: Q12383

TRM13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13, yeastyeast

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM13Q12383 NRT1YOR071C 1797 nt8.12□□□□□ -1.11
TRM13Q12383 DTR1YBR180W 1719 nt8.12□□□□□ -1.11
TRM13Q12383 RSC8YFR037C 1674 nt8.12□□□□□ -1.11
TRM13Q12383 UBA4YHR111W 1323 nt8.12□□□□□ -1.11
TRM13Q12383 YDL086WYDL086W 822 nt8.12□□□□□ -1.11
TRM13Q12383 PAM17YKR065C 594 nt8.12□□□□□ -1.11
TRM13Q12383 ARA2YMR041C 1008 nt8.12□□□□□ -1.11
TRM13Q12383 ZTA1YBR046C 1005 nt8.12□□□□□ -1.11
TRM13Q12383 ACH1YBL015W 1581 nt8.11□□□□□ -1.11
TRM13Q12383 DMA2YNL116W 1569 nt8.11□□□□□ -1.11
TRM13Q12383 YCR087WYCR087W 516 nt8.11□□□□□ -1.11
TRM13Q12383 MIR1YJR077C 936 nt8.11□□□□□ -1.11
TRM13Q12383 UTH1YKR042W 1098 nt8.11□□□□□ -1.11
TRM13Q12383 FMS1YMR020W 1527 nt8.11□□□□□ -1.11
TRM13Q12383 DIG1YPL049C 1359 nt8.1□□□□□ -1.11
TRM13Q12383 COQ2YNR041C 1119 nt8.1□□□□□ -1.11
TRM13Q12383 ZAP1YJL056C 2643 nt8.09□□□□□ -1.11
TRM13Q12383 MEP3YPR138C 1470 nt8.09□□□□□ -1.11
TRM13Q12383 YSR3YKR053C 1215 nt8.08□□□□□ -1.12
TRM13Q12383 YMR103CYMR103C 363 nt8.07□□□□□ -1.12
TRM13Q12383 TPO4YOR273C 1980 nt8.07□□□□□ -1.12
TRM13Q12383 YPS3YLR121C 1527 nt8.07□□□□□ -1.12
TRM13Q12383 HMG2YLR450W 3138 nt8.07□□□□□ -1.12
TRM13Q12383 YHL008CYHL008C 1884 nt8.06□□□□□ -1.12
TRM13Q12383 RPL4BYDR012W 1089 nt8.05□□□□□ -1.12
TRM13Q12383 RRT5YFR032C 870 nt8.05□□□□□ -1.12
TRM13Q12383 YLR122CYLR122C 378 nt8.05□□□□□ -1.12
TRM13Q12383 RPL4AYBR031W 1089 nt8.05□□□□□ -1.12
TRM13Q12383 YRF1-2YER190W 5046 nt8.05□□□□□ -1.12
TRM13Q12383 ODC1YPL134C 933 nt8.04□□□□□ -1.12
TRM13Q12383 GID8YMR135C 1368 nt8.04□□□□□ -1.12
TRM13Q12383 SEC61YLR378C 1443 nt8.03□□□□□ -1.12
TRM13Q12383 URH1YDR400W 1023 nt8.03□□□□□ -1.12
TRM13Q12383 SBA1YKL117W 651 nt8.03□□□□□ -1.12
TRM13Q12383 UGA4YDL210W 1716 nt8.03□□□□□ -1.12
TRM13Q12383 FLR1YBR008C 1647 nt8.03□□□□□ -1.12
TRM13Q12383 OXA1YER154W 1209 nt8.02□□□□□ -1.13
TRM13Q12383 DLD2YDL178W 1593 nt8.01□□□□□ -1.13
TRM13Q12383 GAL2YLR081W 1725 nt8.01□□□□□ -1.13
TRM13Q12383 THI74YDR438W 1113 nt8.01□□□□□ -1.13
TRM13Q12383 TOM20YGR082W 552 nt8□□□□□ -1.13
TRM13Q12383 PAB1YER165W 1734 nt7.99□□□□□ -1.13
TRM13Q12383 YHR218WYHR218W 1812 nt7.99□□□□□ -1.13
TRM13Q12383 YKL133CYKL133C 1392 nt7.98□□□□□ -1.13
TRM13Q12383 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.98□□□□□ -1.13
TRM13Q12383 LCP5YER127W 1074 nt7.98□□□□□ -1.13
TRM13Q12383 RPS14BYJL191W 417 nt7.98□□□□□ -1.13
TRM13Q12383 SSL2YIL143C 2532 nt7.98□□□□□ -1.13
TRM13Q12383 MRS6YOR370C 1812 nt7.97□□□□□ -1.13
TRM13Q12383 AIM45YPR004C 1035 nt7.97□□□□□ -1.13
TRM13Q12383 GTB1YDR221W 2109 nt7.97□□□□□ -1.13
TRM13Q12383 URA8YJR103W 1737 nt7.97□□□□□ -1.13
TRM13Q12383 MDM35YKL053C-A 261 nt7.96□□□□□ -1.14
TRM13Q12383 AI5_BETAQ0075 1065 nt7.95□□□□□ -1.14
TRM13Q12383 XYL2YLR070C 1071 nt7.95□□□□□ -1.14
TRM13Q12383 HEM14YER014W 1620 nt7.95□□□□□ -1.14
TRM13Q12383 YER188WYER188W 720 nt7.94□□□□□ -1.14
TRM13Q12383 RFC1YOR217W 2586 nt7.93□□□□□ -1.14
TRM13Q12383 HEM13YDR044W 987 nt7.92□□□□□ -1.14
TRM13Q12383 CWP2YKL096W-A 279 nt7.92□□□□□ -1.14
TRM13Q12383 HXK1YFR053C 1458 nt7.91□□□□□ -1.14
TRM13Q12383 YHR219WYHR219W 1875 nt7.9□□□□□ -1.14
TRM13Q12383 OSH7YHR001W 1314 nt7.9□□□□□ -1.14
TRM13Q12383 BNI5YNL166C 1347 nt7.89□□□□□ -1.15
TRM13Q12383 ABZ2YMR289W 1125 nt7.89□□□□□ -1.15
TRM13Q12383 LSR1LSR1 1175 nt7.89□□□□□ -1.15
TRM13Q12383 HXT10YFL011W 1641 nt7.89□□□□□ -1.15
TRM13Q12383 ALD5YER073W 1563 nt7.88□□□□□ -1.15
TRM13Q12383 APT2YDR441C 546 nt7.88□□□□□ -1.15
TRM13Q12383 YGL034CYGL034C 366 nt7.88□□□□□ -1.15
TRM13Q12383 TIM44YIL022W 1296 nt7.88□□□□□ -1.15
TRM13Q12383 AIM1YAL046C 357 nt7.88□□□□□ -1.15
TRM13Q12383 YLR046CYLR046C 813 nt7.88□□□□□ -1.15
TRM13Q12383 PHO23YNL097C 993 nt7.88□□□□□ -1.15
TRM13Q12383 TSC10YBR265W 963 nt7.88□□□□□ -1.15
TRM13Q12383 RPD3YNL330C 1302 nt7.87□□□□□ -1.15
TRM13Q12383 ENT4YLL038C 744 nt7.87□□□□□ -1.15
TRM13Q12383 NAT4YMR069W 858 nt7.87□□□□□ -1.15
TRM13Q12383 MSC1YML128C 1542 nt7.87□□□□□ -1.15
TRM13Q12383 MSF1YPR047W 1410 nt7.86□□□□□ -1.15
TRM13Q12383 FUB1YCR076C 753 nt7.86□□□□□ -1.15
TRM13Q12383 YDR094WYDR094W 336 nt7.86□□□□□ -1.15
TRM13Q12383 BUR6YER159C 429 nt7.86□□□□□ -1.15
TRM13Q12383 PCP1YGR101W 1041 nt7.86□□□□□ -1.15
TRM13Q12383 PAU16YKL224C 372 nt7.86□□□□□ -1.15
TRM13Q12383 DLD3YEL071W 1491 nt7.86□□□□□ -1.15
TRM13Q12383 TOK1YJL093C 2076 nt7.85□□□□□ -1.15
TRM13Q12383 THI72YOR192C 1800 nt7.85□□□□□ -1.15
TRM13Q12383 YJL118WYJL118W 660 nt7.83□□□□□ -1.16
TRM13Q12383 YLR279WYLR279W 390 nt7.83□□□□□ -1.16
TRM13Q12383 YOR072WYOR072W 315 nt7.83□□□□□ -1.16
TRM13Q12383 NUC1YJL208C 990 nt7.82□□□□□ -1.16
TRM13Q12383 YMR262WYMR262W 942 nt7.82□□□□□ -1.16
TRM13Q12383 ASP3-1YLR155C 1089 nt7.81□□□□□ -1.16
TRM13Q12383 ASP3-2YLR157C 1089 nt7.81□□□□□ -1.16
TRM13Q12383 ASP3-3YLR158C 1089 nt7.81□□□□□ -1.16
TRM13Q12383 ASP3-4YLR160C 1089 nt7.81□□□□□ -1.16
TRM13Q12383 RAS2YNL098C 969 nt7.8□□□□□ -1.16
TRM13Q12383 FCY21YER060W 1587 nt7.8□□□□□ -1.16
TRM13Q12383 AGP3YFL055W 1677 nt7.79□□□□□ -1.16
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