Protein–RNA interactions for Protein: Q12255

NYV1, Vacuolar v-SNARE NYV1, yeastyeast

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NYV1Q12255 LSB5YCL034W 1065 nt11.33□□□□□ -0.6
NYV1Q12255 BRR1YPR057W 1026 nt11.32□□□□□ -0.6
NYV1Q12255 PAC11YDR488C 1602 nt11.31□□□□□ -0.6
NYV1Q12255 SNZ1YMR096W 894 nt11.31□□□□□ -0.6
NYV1Q12255 YBL086CYBL086C 1401 nt11.29□□□□□ -0.6
NYV1Q12255 TOA2YKL058W 369 nt11.28□□□□□ -0.6
NYV1Q12255 RPT5YOR117W 1305 nt11.28□□□□□ -0.6
NYV1Q12255 DBP1YPL119C 1854 nt11.27□□□□□ -0.6
NYV1Q12255 SAM3YPL274W 1764 nt11.27□□□□□ -0.61
NYV1Q12255 LEU9YOR108W 1815 nt11.26□□□□□ -0.61
NYV1Q12255 PAR32YDL173W 888 nt11.26□□□□□ -0.61
NYV1Q12255 SSN3YPL042C 1668 nt11.26□□□□□ -0.61
NYV1Q12255 PRP4YPR178W 1398 nt11.26□□□□□ -0.61
NYV1Q12255 TUB4YLR212C 1422 nt11.26□□□□□ -0.61
NYV1Q12255 IRC24YIR036C 792 nt11.25□□□□□ -0.61
NYV1Q12255 HXT1YHR094C 1713 nt11.24□□□□□ -0.61
NYV1Q12255 RIB7YBR153W 735 nt11.24□□□□□ -0.61
NYV1Q12255 NUC1YJL208C 990 nt11.23□□□□□ -0.61
NYV1Q12255 QDR2YIL121W 1629 nt11.23□□□□□ -0.61
NYV1Q12255 GND2YGR256W 1479 nt11.22□□□□□ -0.61
NYV1Q12255 BNI5YNL166C 1347 nt11.22□□□□□ -0.61
NYV1Q12255 POT1YIL160C 1254 nt11.21□□□□□ -0.61
NYV1Q12255 MHF1YOL086W-A 273 nt11.2□□□□□ -0.62
NYV1Q12255 APS2YJR058C 444 nt11.19□□□□□ -0.62
NYV1Q12255 HIF1YLL022C 1158 nt11.19□□□□□ -0.62
NYV1Q12255 GSF2YML048W 1212 nt11.19□□□□□ -0.62
NYV1Q12255 PHO23YNL097C 993 nt11.18□□□□□ -0.62
NYV1Q12255 DPS1YLL018C 1674 nt11.17□□□□□ -0.62
NYV1Q12255 POP2YNR052C 1302 nt11.17□□□□□ -0.62
NYV1Q12255 CTI6YPL181W 1521 nt11.16□□□□□ -0.62
NYV1Q12255 BMT6YLR063W 1098 nt11.16□□□□□ -0.62
NYV1Q12255 YPR126CYPR126C 309 nt11.16□□□□□ -0.62
NYV1Q12255 TPS1YBR126C 1488 nt11.16□□□□□ -0.62
NYV1Q12255 TRT2tT(CGU)K 72 nt11.14□□□□□ -0.63
NYV1Q12255 MSC1YML128C 1542 nt11.14□□□□□ -0.63
NYV1Q12255 YER152W-AYER152W-A 567 nt11.13□□□□□ -0.63
NYV1Q12255 YJL225CYJL225C 5277 nt11.11□□□□□ -0.63
NYV1Q12255 NIF3YGL221C 867 nt11.11□□□□□ -0.63
NYV1Q12255 DAK2YFL053W 1776 nt11.09□□□□□ -0.63
NYV1Q12255 IML3YBR107C 738 nt11.09□□□□□ -0.63
NYV1Q12255 RAS2YNL098C 969 nt11.08□□□□□ -0.64
NYV1Q12255 SHY1YGR112W 1170 nt11.07□□□□□ -0.64
NYV1Q12255 OYE2YHR179W 1203 nt11.07□□□□□ -0.64
NYV1Q12255 UFO1YML088W 2007 nt11.07□□□□□ -0.64
NYV1Q12255 SAM2YDR502C 1155 nt11.06□□□□□ -0.64
NYV1Q12255 SEC61YLR378C 1443 nt11.06□□□□□ -0.64
NYV1Q12255 SAM50YNL026W 1455 nt11.06□□□□□ -0.64
NYV1Q12255 YCP4YCR004C 744 nt11.05□□□□□ -0.64
NYV1Q12255 FUB1YCR076C 753 nt11.05□□□□□ -0.64
NYV1Q12255 BUD20YLR074C 501 nt11.05□□□□□ -0.64
NYV1Q12255 IGD1YFR017C 588 nt11.04□□□□□ -0.64
NYV1Q12255 FRE6YLL051C 2139 nt11.03□□□□□ -0.64
NYV1Q12255 EAF3YPR023C 1206 nt11.03□□□□□ -0.64
NYV1Q12255 YNL024CYNL024C 741 nt11.02□□□□□ -0.65
NYV1Q12255 OXA1YER154W 1209 nt11□□□□□ -0.65
NYV1Q12255 YER188WYER188W 720 nt11□□□□□ -0.65
NYV1Q12255 OYE3YPL171C 1203 nt10.99□□□□□ -0.65
NYV1Q12255 SNF1YDR477W 1902 nt10.98□□□□□ -0.65
NYV1Q12255 KRE1YNL322C 942 nt10.98□□□□□ -0.65
NYV1Q12255 TMA23YMR269W 636 nt10.96□□□□□ -0.65
NYV1Q12255 YCR025CYCR025C 411 nt10.95□□□□□ -0.66
NYV1Q12255 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt10.95□□□□□ -0.66
NYV1Q12255 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt10.95□□□□□ -0.66
NYV1Q12255 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt10.95□□□□□ -0.66
NYV1Q12255 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt10.95□□□□□ -0.66
NYV1Q12255 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt10.95□□□□□ -0.66
NYV1Q12255 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt10.95□□□□□ -0.66
NYV1Q12255 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt10.95□□□□□ -0.66
NYV1Q12255 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt10.95□□□□□ -0.66
NYV1Q12255 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt10.95□□□□□ -0.66
NYV1Q12255 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt10.95□□□□□ -0.66
NYV1Q12255 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt10.95□□□□□ -0.66
NYV1Q12255 DDI1YER143W 1287 nt10.95□□□□□ -0.66
NYV1Q12255 URA6YKL024C 615 nt10.95□□□□□ -0.66
NYV1Q12255 IPL1YPL209C 1104 nt10.94□□□□□ -0.66
NYV1Q12255 ACO2YJL200C 2370 nt10.92□□□□□ -0.66
NYV1Q12255 DLD2YDL178W 1593 nt10.91□□□□□ -0.66
NYV1Q12255 FLR1YBR008C 1647 nt10.91□□□□□ -0.66
NYV1Q12255 LSM5YER146W 282 nt10.9□□□□□ -0.66
NYV1Q12255 CDD1YLR245C 429 nt10.9□□□□□ -0.66
NYV1Q12255 PET8YNL003C 855 nt10.9□□□□□ -0.66
NYV1Q12255 LYS20YDL182W 1287 nt10.89□□□□□ -0.67
NYV1Q12255 NAS2YIL007C 663 nt10.89□□□□□ -0.67
NYV1Q12255 IMO32YGR031W 1029 nt10.88□□□□□ -0.67
NYV1Q12255 SPS100YHR139C 981 nt10.88□□□□□ -0.67
NYV1Q12255 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt10.87□□□□□ -0.67
NYV1Q12255 OSH7YHR001W 1314 nt10.85□□□□□ -0.67
NYV1Q12255 SOL2YCR073W-A 948 nt10.85□□□□□ -0.67
NYV1Q12255 SWM1YDR260C 513 nt10.85□□□□□ -0.67
NYV1Q12255 NVJ2YPR091C 2313 nt10.84□□□□□ -0.67
NYV1Q12255 YPS3YLR121C 1527 nt10.79□□□□□ -0.68
NYV1Q12255 HEM13YDR044W 987 nt10.79□□□□□ -0.68
NYV1Q12255 RSC8YFR037C 1674 nt10.79□□□□□ -0.68
NYV1Q12255 FMS1YMR020W 1527 nt10.79□□□□□ -0.68
NYV1Q12255 YDR455CYDR455C 309 nt10.78□□□□□ -0.68
NYV1Q12255 FLX1YIL134W 936 nt10.78□□□□□ -0.68
NYV1Q12255 SPE2YOL052C 1191 nt10.77□□□□□ -0.69
NYV1Q12255 ZRT3YKL175W 1512 nt10.77□□□□□ -0.69
NYV1Q12255 BOR1YNL275W 1731 nt10.75□□□□□ -0.69
NYV1Q12255 TAT2YOL020W 1779 nt10.75□□□□□ -0.69
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