Protein–RNA interactions for Protein: Q12254

SVS1, Protein SVS1, yeastyeast

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SVS1Q12254 PBP1YGR178C 2169 nt9.54□□□□□ -0.88
SVS1Q12254 RPM1RPM1 483 nt9.52□□□□□ -0.89
SVS1Q12254 GPN2YOR262W 1044 nt9.51□□□□□ -0.89
SVS1Q12254 ARO7YPR060C 771 nt9.51□□□□□ -0.89
SVS1Q12254 SHY1YGR112W 1170 nt9.5□□□□□ -0.89
SVS1Q12254 CPD1YGR247W 720 nt9.5□□□□□ -0.89
SVS1Q12254 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.49□□□□□ -0.89
SVS1Q12254 CSM1YCR086W 573 nt9.48□□□□□ -0.89
SVS1Q12254 YJL055WYJL055W 738 nt9.48□□□□□ -0.89
SVS1Q12254 LSB5YCL034W 1065 nt9.48□□□□□ -0.89
SVS1Q12254 GND2YGR256W 1479 nt9.47□□□□□ -0.89
SVS1Q12254 SSN3YPL042C 1668 nt9.47□□□□□ -0.89
SVS1Q12254 ZRT3YKL175W 1512 nt9.46□□□□□ -0.89
SVS1Q12254 CMP2YML057W 1815 nt9.45□□□□□ -0.9
SVS1Q12254 NUC1YJL208C 990 nt9.45□□□□□ -0.9
SVS1Q12254 CYT2YKL087C 675 nt9.45□□□□□ -0.9
SVS1Q12254 FRE6YLL051C 2139 nt9.45□□□□□ -0.9
SVS1Q12254 UFO1YML088W 2007 nt9.44□□□□□ -0.9
SVS1Q12254 SAM2YDR502C 1155 nt9.44□□□□□ -0.9
SVS1Q12254 URA6YKL024C 615 nt9.44□□□□□ -0.9
SVS1Q12254 PHO23YNL097C 993 nt9.43□□□□□ -0.9
SVS1Q12254 SEC61YLR378C 1443 nt9.42□□□□□ -0.9
SVS1Q12254 BNI5YNL166C 1347 nt9.41□□□□□ -0.9
SVS1Q12254 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.41□□□□□ -0.9
SVS1Q12254 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.41□□□□□ -0.9
SVS1Q12254 YJL118WYJL118W 660 nt9.41□□□□□ -0.9
SVS1Q12254 OYE3YPL171C 1203 nt9.41□□□□□ -0.9
SVS1Q12254 RPT5YOR117W 1305 nt9.4□□□□□ -0.9
SVS1Q12254 OXA1YER154W 1209 nt9.39□□□□□ -0.91
SVS1Q12254 RIB7YBR153W 735 nt9.39□□□□□ -0.91
SVS1Q12254 MSC1YML128C 1542 nt9.38□□□□□ -0.91
SVS1Q12254 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt9.38□□□□□ -0.91
SVS1Q12254 PET8YNL003C 855 nt9.38□□□□□ -0.91
SVS1Q12254 CCT5YJR064W 1689 nt9.38□□□□□ -0.91
SVS1Q12254 ESS1YJR017C 513 nt9.36□□□□□ -0.91
SVS1Q12254 GAL3YDR009W 1563 nt9.34□□□□□ -0.91
SVS1Q12254 SAM3YPL274W 1764 nt9.33□□□□□ -0.92
SVS1Q12254 YER188WYER188W 720 nt9.32□□□□□ -0.92
SVS1Q12254 RAS2YNL098C 969 nt9.31□□□□□ -0.92
SVS1Q12254 THI72YOR192C 1800 nt9.29□□□□□ -0.92
SVS1Q12254 FUB1YCR076C 753 nt9.29□□□□□ -0.92
SVS1Q12254 YJL067WYJL067W 351 nt9.29□□□□□ -0.92
SVS1Q12254 TAF13YML098W 504 nt9.29□□□□□ -0.92
SVS1Q12254 OYE2YHR179W 1203 nt9.28□□□□□ -0.92
SVS1Q12254 YAT1YAR035W 2064 nt9.27□□□□□ -0.93
SVS1Q12254 DLD2YDL178W 1593 nt9.26□□□□□ -0.93
SVS1Q12254 TPS1YBR126C 1488 nt9.26□□□□□ -0.93
SVS1Q12254 HEL2YDR266C 1920 nt9.25□□□□□ -0.93
SVS1Q12254 PAU5YFL020C 369 nt9.24□□□□□ -0.93
SVS1Q12254 FLR1YBR008C 1647 nt9.23□□□□□ -0.93
SVS1Q12254 RSC8YFR037C 1674 nt9.23□□□□□ -0.93
SVS1Q12254 CWC15YDR163W 528 nt9.22□□□□□ -0.93
SVS1Q12254 STP3YLR375W 1032 nt9.22□□□□□ -0.93
SVS1Q12254 PGC1YPL206C 966 nt9.22□□□□□ -0.93
SVS1Q12254 EAF3YPR023C 1206 nt9.22□□□□□ -0.93
SVS1Q12254 OSH7YHR001W 1314 nt9.22□□□□□ -0.93
SVS1Q12254 YPS3YLR121C 1527 nt9.21□□□□□ -0.93
SVS1Q12254 SNZ1YMR096W 894 nt9.21□□□□□ -0.94
SVS1Q12254 FMS1YMR020W 1527 nt9.21□□□□□ -0.94
SVS1Q12254 SEN2YLR105C 1134 nt9.2□□□□□ -0.94
SVS1Q12254 NAP1YKR048C 1254 nt9.19□□□□□ -0.94
SVS1Q12254 MHF1YOL086W-A 273 nt9.19□□□□□ -0.94
SVS1Q12254 YPR126CYPR126C 309 nt9.19□□□□□ -0.94
SVS1Q12254 YBR232CYBR232C 360 nt9.19□□□□□ -0.94
SVS1Q12254 DAK2YFL053W 1776 nt9.18□□□□□ -0.94
SVS1Q12254 SPP2YOR148C 558 nt9.18□□□□□ -0.94
SVS1Q12254 YMR262WYMR262W 942 nt9.16□□□□□ -0.94
SVS1Q12254 YNL024CYNL024C 741 nt9.16□□□□□ -0.94
SVS1Q12254 REG2YBR050C 1017 nt9.16□□□□□ -0.94
SVS1Q12254 IML3YBR107C 738 nt9.16□□□□□ -0.94
SVS1Q12254 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt9.15□□□□□ -0.94
SVS1Q12254 POT1YIL160C 1254 nt9.15□□□□□ -0.94
SVS1Q12254 TMA23YMR269W 636 nt9.15□□□□□ -0.94
SVS1Q12254 CTI6YPL181W 1521 nt9.15□□□□□ -0.95
SVS1Q12254 SOL2YCR073W-A 948 nt9.14□□□□□ -0.95
SVS1Q12254 HEM13YDR044W 987 nt9.13□□□□□ -0.95
SVS1Q12254 GSF2YML048W 1212 nt9.13□□□□□ -0.95
SVS1Q12254 VPS62YGR141W 1404 nt9.13□□□□□ -0.95
SVS1Q12254 LSM5YER146W 282 nt9.12□□□□□ -0.95
SVS1Q12254 INA1YLR413W 2028 nt9.11□□□□□ -0.95
SVS1Q12254 DDI1YER143W 1287 nt9.11□□□□□ -0.95
SVS1Q12254 YJR154WYJR154W 1041 nt9.1□□□□□ -0.95
SVS1Q12254 ACH1YBL015W 1581 nt9.09□□□□□ -0.95
SVS1Q12254 PAR32YDL173W 888 nt9.09□□□□□ -0.95
SVS1Q12254 IMO32YGR031W 1029 nt9.09□□□□□ -0.95
SVS1Q12254 TUB4YLR212C 1422 nt9.07□□□□□ -0.96
SVS1Q12254 YDL086WYDL086W 822 nt9.07□□□□□ -0.96
SVS1Q12254 PUP1YOR157C 786 nt9.07□□□□□ -0.96
SVS1Q12254 YJL064WYJL064W 396 nt9.06□□□□□ -0.96
SVS1Q12254 ASP3-1YLR155C 1089 nt9.05□□□□□ -0.96
SVS1Q12254 ASP3-2YLR157C 1089 nt9.05□□□□□ -0.96
SVS1Q12254 ASP3-3YLR158C 1089 nt9.05□□□□□ -0.96
SVS1Q12254 ASP3-4YLR160C 1089 nt9.05□□□□□ -0.96
SVS1Q12254 TAT2YOL020W 1779 nt9.04□□□□□ -0.96
SVS1Q12254 SPT20YOL148C 1815 nt9.04□□□□□ -0.96
SVS1Q12254 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.04□□□□□ -0.96
SVS1Q12254 PAU19YMR325W 375 nt9.03□□□□□ -0.96
SVS1Q12254 RRT8YOL048C 1029 nt9.03□□□□□ -0.96
SVS1Q12254 SPS100YHR139C 981 nt9.02□□□□□ -0.97
SVS1Q12254 YDR455CYDR455C 309 nt9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.3 ms