Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 FMS1YMR020W 1527 nt9.17□□□□□ -0.94
UBX3Q12229 OXA1YER154W 1209 nt9.17□□□□□ -0.94
UBX3Q12229 SEC61YLR378C 1443 nt9.16□□□□□ -0.94
UBX3Q12229 CSM1YCR086W 573 nt9.16□□□□□ -0.94
UBX3Q12229 BNI5YNL166C 1347 nt9.15□□□□□ -0.94
UBX3Q12229 PHO23YNL097C 993 nt9.15□□□□□ -0.94
UBX3Q12229 MSC1YML128C 1542 nt9.15□□□□□ -0.95
UBX3Q12229 CWC15YDR163W 528 nt9.14□□□□□ -0.95
UBX3Q12229 ACH1YBL015W 1581 nt9.14□□□□□ -0.95
UBX3Q12229 BSP1YPR171W 1731 nt9.14□□□□□ -0.95
UBX3Q12229 SAM2YDR502C 1155 nt9.13□□□□□ -0.95
UBX3Q12229 YOR325WYOR325W 474 nt9.13□□□□□ -0.95
UBX3Q12229 YPS3YLR121C 1527 nt9.13□□□□□ -0.95
UBX3Q12229 RSC8YFR037C 1674 nt9.13□□□□□ -0.95
UBX3Q12229 DLD2YDL178W 1593 nt9.12□□□□□ -0.95
UBX3Q12229 ILV3YJR016C 1758 nt9.12□□□□□ -0.95
UBX3Q12229 SPP2YOR148C 558 nt9.11□□□□□ -0.95
UBX3Q12229 HSL7YBR133C 2484 nt9.1□□□□□ -0.95
UBX3Q12229 FUB1YCR076C 753 nt9.1□□□□□ -0.95
UBX3Q12229 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.1□□□□□ -0.95
UBX3Q12229 HXT12YIL170W 1374 nt9.09□□□□□ -0.95
UBX3Q12229 SAM3YPL274W 1764 nt9.08□□□□□ -0.96
UBX3Q12229 HEM13YDR044W 987 nt9.07□□□□□ -0.96
UBX3Q12229 YER188WYER188W 720 nt9.07□□□□□ -0.96
UBX3Q12229 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.07□□□□□ -0.96
UBX3Q12229 YPI1YFR003C 468 nt9.06□□□□□ -0.96
UBX3Q12229 YJL055WYJL055W 738 nt9.05□□□□□ -0.96
UBX3Q12229 YNR029CYNR029C 1290 nt9.05□□□□□ -0.96
UBX3Q12229 OPI10YOL032W 741 nt9.05□□□□□ -0.96
UBX3Q12229 HOL1YNR055C 1761 nt9.04□□□□□ -0.96
UBX3Q12229 CCT2YIL142W 1584 nt9.03□□□□□ -0.96
UBX3Q12229 NUC1YJL208C 990 nt9.03□□□□□ -0.96
UBX3Q12229 YNL024CYNL024C 741 nt9.03□□□□□ -0.96
UBX3Q12229 ADH1YOL086C 1047 nt9.03□□□□□ -0.96
UBX3Q12229 LSB5YCL034W 1065 nt9.03□□□□□ -0.96
UBX3Q12229 RIB2YOL066C 1776 nt9.03□□□□□ -0.96
UBX3Q12229 MUP1YGR055W 1725 nt9.02□□□□□ -0.96
UBX3Q12229 VRG4YGL225W 1014 nt9.02□□□□□ -0.97
UBX3Q12229 YJL118WYJL118W 660 nt9.02□□□□□ -0.97
UBX3Q12229 RPT5YOR117W 1305 nt9.01□□□□□ -0.97
UBX3Q12229 VPS62YGR141W 1404 nt9□□□□□ -0.97
UBX3Q12229 LSB6YJL100W 1824 nt9□□□□□ -0.97
UBX3Q12229 RAS2YNL098C 969 nt8.99□□□□□ -0.97
UBX3Q12229 OSH7YHR001W 1314 nt8.98□□□□□ -0.97
UBX3Q12229 TAT2YOL020W 1779 nt8.96□□□□□ -0.97
UBX3Q12229 YDL086WYDL086W 822 nt8.96□□□□□ -0.98
UBX3Q12229 EAF3YPR023C 1206 nt8.96□□□□□ -0.98
UBX3Q12229 ARO8YGL202W 1503 nt8.95□□□□□ -0.98
UBX3Q12229 GAL3YDR009W 1563 nt8.95□□□□□ -0.98
UBX3Q12229 OYE2YHR179W 1203 nt8.94□□□□□ -0.98
UBX3Q12229 TPS1YBR126C 1488 nt8.94□□□□□ -0.98
UBX3Q12229 SOL2YCR073W-A 948 nt8.93□□□□□ -0.98
UBX3Q12229 COQ8YGL119W 1506 nt8.92□□□□□ -0.98
UBX3Q12229 YDR455CYDR455C 309 nt8.91□□□□□ -0.98
UBX3Q12229 YJL195CYJL195C 702 nt8.89□□□□□ -0.99
UBX3Q12229 RIB7YBR153W 735 nt8.89□□□□□ -0.99
UBX3Q12229 GPN2YOR262W 1044 nt8.88□□□□□ -0.99
UBX3Q12229 BET2YPR176C 978 nt8.88□□□□□ -0.99
UBX3Q12229 KES1YPL145C 1305 nt8.87□□□□□ -0.99
UBX3Q12229 ZAP1YJL056C 2643 nt8.86□□□□□ -0.99
UBX3Q12229 SGA1YIL099W 1650 nt8.86□□□□□ -0.99
UBX3Q12229 TMA23YMR269W 636 nt8.86□□□□□ -0.99
UBX3Q12229 QDR2YIL121W 1629 nt8.85□□□□□ -0.99
UBX3Q12229 DDI1YER143W 1287 nt8.85□□□□□ -0.99
UBX3Q12229 FUN14YAL008W 597 nt8.85□□□□□ -0.99
UBX3Q12229 AIM1YAL046C 357 nt8.84□□□□□ -0.99
UBX3Q12229 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.84□□□□□ -0.99
UBX3Q12229 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.84□□□□□ -0.99
UBX3Q12229 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.84□□□□□ -0.99
UBX3Q12229 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.84□□□□□ -0.99
UBX3Q12229 UGP1YKL035W 1500 nt8.84□□□□□ -0.99
UBX3Q12229 DIG1YPL049C 1359 nt8.84□□□□□ -0.99
UBX3Q12229 LSM5YER146W 282 nt8.83□□□□□ -1
UBX3Q12229 SNZ1YMR096W 894 nt8.82□□□□□ -1
UBX3Q12229 CCT5YJR064W 1689 nt8.81□□□□□ -1
UBX3Q12229 YGL114WYGL114W 2178 nt8.8□□□□□ -1
UBX3Q12229 RIM8YGL045W 1629 nt8.8□□□□□ -1
UBX3Q12229 IMO32YGR031W 1029 nt8.8□□□□□ -1
UBX3Q12229 DAK2YFL053W 1776 nt8.79□□□□□ -1
UBX3Q12229 ERG13YML126C 1476 nt8.79□□□□□ -1
UBX3Q12229 GID8YMR135C 1368 nt8.78□□□□□ -1
UBX3Q12229 YEL008WYEL008W 381 nt8.78□□□□□ -1
UBX3Q12229 HIS2YFR025C 1008 nt8.77□□□□□ -1.01
UBX3Q12229 ENT4YLL038C 744 nt8.77□□□□□ -1.01
UBX3Q12229 RRT8YOL048C 1029 nt8.77□□□□□ -1.01
UBX3Q12229 YPR126CYPR126C 309 nt8.77□□□□□ -1.01
UBX3Q12229 SAC7YDR389W 1965 nt8.76□□□□□ -1.01
UBX3Q12229 YHR219WYHR219W 1875 nt8.75□□□□□ -1.01
UBX3Q12229 MRS6YOR370C 1812 nt8.75□□□□□ -1.01
UBX3Q12229 YLR046CYLR046C 813 nt8.74□□□□□ -1.01
UBX3Q12229 DLD3YEL071W 1491 nt8.74□□□□□ -1.01
UBX3Q12229 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.72□□□□□ -1.01
UBX3Q12229 YLR349WYLR349W 507 nt8.72□□□□□ -1.01
UBX3Q12229 STE4YOR212W 1272 nt8.72□□□□□ -1.01
UBX3Q12229 GID7YCL039W 2238 nt8.72□□□□□ -1.01
UBX3Q12229 ITR2YOL103W 1830 nt8.71□□□□□ -1.01
UBX3Q12229 YKL133CYKL133C 1392 nt8.71□□□□□ -1.02
UBX3Q12229 RAD51YER095W 1203 nt8.69□□□□□ -1.02
UBX3Q12229 CTI6YPL181W 1521 nt8.69□□□□□ -1.02
UBX3Q12229 THI72YOR192C 1800 nt8.68□□□□□ -1.02
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