Protein–RNA interactions for Protein: Q12186

MSL5, Branchpoint-bridging protein, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSL5Q12186 PLB1YMR008C 1995 nt8.48□□□□□ -1.05
MSL5Q12186 CSM2YIL132C 642 nt8.47□□□□□ -1.05
MSL5Q12186 RIB1YBL033C 1038 nt8.46□□□□□ -1.06 RIP-Chip
MSL5Q12186 CCT5YJR064W 1689 nt8.46□□□□□ -1.06
MSL5Q12186 CMP2YML057W 1815 nt8.45□□□□□ -1.06
MSL5Q12186 TOK1YJL093C 2076 nt8.44□□□□□ -1.06
MSL5Q12186 GAL2YLR081W 1725 nt8.43□□□□□ -1.06
MSL5Q12186 YJL055WYJL055W 738 nt8.41□□□□□ -1.06
MSL5Q12186 UGA4YDL210W 1716 nt8.4□□□□□ -1.07
MSL5Q12186 ERG6YML008C 1152 nt8.39□□□□□ -1.07
MSL5Q12186 TAF13YML098W 504 nt8.39□□□□□ -1.07
MSL5Q12186 URA8YJR103W 1737 nt8.39□□□□□ -1.07
MSL5Q12186 UTR1YJR049C 1593 nt8.38□□□□□ -1.07 RIP-Chip
MSL5Q12186 TIP1YBR067C 633 nt8.37□□□□□ -1.07
MSL5Q12186 YIA6YIL006W 1122 nt8.36□□□□□ -1.07
MSL5Q12186 THI72YOR192C 1800 nt8.36□□□□□ -1.07
MSL5Q12186 PAR32YDL173W 888 nt8.35□□□□□ -1.07
MSL5Q12186 SOD2YHR008C 702 nt8.35□□□□□ -1.07
MSL5Q12186 SED1YDR077W 1017 nt8.34□□□□□ -1.07
MSL5Q12186 HSP60YLR259C 1719 nt8.33□□□□□ -1.08
MSL5Q12186 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.31□□□□□ -1.08
MSL5Q12186 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.31□□□□□ -1.08
MSL5Q12186 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.31□□□□□ -1.08
MSL5Q12186 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.31□□□□□ -1.08
MSL5Q12186 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.31□□□□□ -1.08
MSL5Q12186 YMR262WYMR262W 942 nt8.3□□□□□ -1.08
MSL5Q12186 CSM1YCR086W 573 nt8.29□□□□□ -1.08
MSL5Q12186 GAL3YDR009W 1563 nt8.28□□□□□ -1.08
MSL5Q12186 SAM35YHR083W 990 nt8.28□□□□□ -1.08
MSL5Q12186 FUR4YBR021W 1902 nt8.28□□□□□ -1.08
MSL5Q12186 RSC4YKR008W 1878 nt8.28□□□□□ -1.08
MSL5Q12186 MAE1YKL029C 2010 nt8.27□□□□□ -1.09
MSL5Q12186 MCM5YLR274W 2328 nt8.26□□□□□ -1.09
MSL5Q12186 GSF2YML048W 1212 nt8.26□□□□□ -1.09
MSL5Q12186 LIP1YMR298W 453 nt8.26□□□□□ -1.09
MSL5Q12186 LSB5YCL034W 1065 nt8.26□□□□□ -1.09
MSL5Q12186 TUB4YLR212C 1422 nt8.26□□□□□ -1.09
MSL5Q12186 YJL118WYJL118W 660 nt8.25□□□□□ -1.09
MSL5Q12186 POP2YNR052C 1302 nt8.25□□□□□ -1.09
MSL5Q12186 QDR2YIL121W 1629 nt8.25□□□□□ -1.09
MSL5Q12186 MHF1YOL086W-A 273 nt8.24□□□□□ -1.09
MSL5Q12186 SNZ1YMR096W 894 nt8.23□□□□□ -1.09
MSL5Q12186 YPL251WYPL251W 303 nt8.23□□□□□ -1.09
MSL5Q12186 RIB7YBR153W 735 nt8.23□□□□□ -1.09
MSL5Q12186 YCP4YCR004C 744 nt8.22□□□□□ -1.09
MSL5Q12186 POT1YIL160C 1254 nt8.22□□□□□ -1.09
MSL5Q12186 YER152W-AYER152W-A 567 nt8.21□□□□□ -1.1
MSL5Q12186 YGR259CYGR259C 441 nt8.21□□□□□ -1.1
MSL5Q12186 RPT5YOR117W 1305 nt8.21□□□□□ -1.1
MSL5Q12186 MEP3YPR138C 1470 nt8.2□□□□□ -1.1
MSL5Q12186 FRA1YLL029W 2250 nt8.19□□□□□ -1.1
MSL5Q12186 HIF1YLL022C 1158 nt8.18□□□□□ -1.1
MSL5Q12186 YMR103CYMR103C 363 nt8.18□□□□□ -1.1
MSL5Q12186 PAU21YOR394W 495 nt8.18□□□□□ -1.1
MSL5Q12186 PAU22YPL282C 495 nt8.18□□□□□ -1.1
MSL5Q12186 YKR005CYKR005C 1578 nt8.18□□□□□ -1.1
MSL5Q12186 PRM5YIL117C 957 nt8.17□□□□□ -1.1
MSL5Q12186 NUC1YJL208C 990 nt8.17□□□□□ -1.1
MSL5Q12186 BRR1YPR057W 1026 nt8.17□□□□□ -1.1
MSL5Q12186 YPR126CYPR126C 309 nt8.17□□□□□ -1.1
MSL5Q12186 SAM3YPL274W 1764 nt8.17□□□□□ -1.1
MSL5Q12186 LEU9YOR108W 1815 nt8.17□□□□□ -1.1
MSL5Q12186 APS2YJR058C 444 nt8.16□□□□□ -1.1
MSL5Q12186 YBL086CYBL086C 1401 nt8.15□□□□□ -1.1
MSL5Q12186 DBP1YPL119C 1854 nt8.15□□□□□ -1.11
MSL5Q12186 SAM50YNL026W 1455 nt8.14□□□□□ -1.11
MSL5Q12186 PHO23YNL097C 993 nt8.14□□□□□ -1.11
MSL5Q12186 CTI6YPL181W 1521 nt8.13□□□□□ -1.11
MSL5Q12186 IRC24YIR036C 792 nt8.13□□□□□ -1.11
MSL5Q12186 TOA2YKL058W 369 nt8.13□□□□□ -1.11
MSL5Q12186 NIF3YGL221C 867 nt8.12□□□□□ -1.11
MSL5Q12186 ARO7YPR060C 771 nt8.12□□□□□ -1.11
MSL5Q12186 IML3YBR107C 738 nt8.12□□□□□ -1.11
MSL5Q12186 BNI5YNL166C 1347 nt8.11□□□□□ -1.11
MSL5Q12186 BUD20YLR074C 501 nt8.11□□□□□ -1.11
MSL5Q12186 HXT1YHR094C 1713 nt8.11□□□□□ -1.11
MSL5Q12186 MSC1YML128C 1542 nt8.1□□□□□ -1.11
MSL5Q12186 IGD1YFR017C 588 nt8.1□□□□□ -1.11
MSL5Q12186 KRE1YNL322C 942 nt8.1□□□□□ -1.11
MSL5Q12186 DAK2YFL053W 1776 nt8.1□□□□□ -1.11
MSL5Q12186 TPS1YBR126C 1488 nt8.07□□□□□ -1.12
MSL5Q12186 CYT2YKL087C 675 nt8.07□□□□□ -1.12
MSL5Q12186 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.06□□□□□ -1.12
MSL5Q12186 BMT6YLR063W 1098 nt8.06□□□□□ -1.12
MSL5Q12186 GND2YGR256W 1479 nt8.06□□□□□ -1.12
MSL5Q12186 PBP1YGR178C 2169 nt8.05□□□□□ -1.12
MSL5Q12186 YNL024CYNL024C 741 nt8.05□□□□□ -1.12
MSL5Q12186 OYE2YHR179W 1203 nt8.04□□□□□ -1.12
MSL5Q12186 YCR025CYCR025C 411 nt8.03□□□□□ -1.12
MSL5Q12186 SWM1YDR260C 513 nt8.03□□□□□ -1.12
MSL5Q12186 OXA1YER154W 1209 nt8.03□□□□□ -1.12
MSL5Q12186 IPL1YPL209C 1104 nt8.03□□□□□ -1.12
MSL5Q12186 SEC61YLR378C 1443 nt8.03□□□□□ -1.12
MSL5Q12186 PRP4YPR178W 1398 nt8.02□□□□□ -1.13
MSL5Q12186 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt8.02□□□□□ -1.13
MSL5Q12186 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt8.02□□□□□ -1.13
MSL5Q12186 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt8.02□□□□□ -1.13
MSL5Q12186 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt8.02□□□□□ -1.13
MSL5Q12186 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt8.02□□□□□ -1.13
MSL5Q12186 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt8.02□□□□□ -1.13
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