Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 CSM1YCR086W 573 nt9.7□□□□□ -0.86
VPS54Q12071 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.7□□□□□ -0.86
VPS54Q12071 YJL055WYJL055W 738 nt9.7□□□□□ -0.86
VPS54Q12071 HXT12YIL170W 1374 nt9.7□□□□□ -0.86
VPS54Q12071 VRG4YGL225W 1014 nt9.69□□□□□ -0.86
VPS54Q12071 YLR349WYLR349W 507 nt9.69□□□□□ -0.86
VPS54Q12071 SSN3YPL042C 1668 nt9.68□□□□□ -0.86
VPS54Q12071 URA6YKL024C 615 nt9.67□□□□□ -0.86
VPS54Q12071 YAT1YAR035W 2064 nt9.67□□□□□ -0.86
VPS54Q12071 BNI5YNL166C 1347 nt9.65□□□□□ -0.86
VPS54Q12071 OYE3YPL171C 1203 nt9.65□□□□□ -0.86
VPS54Q12071 YEL008WYEL008W 381 nt9.63□□□□□ -0.87
VPS54Q12071 YJL067WYJL067W 351 nt9.63□□□□□ -0.87
VPS54Q12071 SAM2YDR502C 1155 nt9.61□□□□□ -0.87
VPS54Q12071 PHO23YNL097C 993 nt9.61□□□□□ -0.87
VPS54Q12071 LSB5YCL034W 1065 nt9.6□□□□□ -0.87
VPS54Q12071 SAM3YPL274W 1764 nt9.6□□□□□ -0.87
VPS54Q12071 SEC61YLR378C 1443 nt9.59□□□□□ -0.87
VPS54Q12071 PET8YNL003C 855 nt9.59□□□□□ -0.87
VPS54Q12071 GPN2YOR262W 1044 nt9.59□□□□□ -0.87
VPS54Q12071 MSC1YML128C 1542 nt9.59□□□□□ -0.87
VPS54Q12071 ADH7YCR105W 1086 nt9.58□□□□□ -0.88
VPS54Q12071 YJL118WYJL118W 660 nt9.58□□□□□ -0.88
VPS54Q12071 NUC1YJL208C 990 nt9.58□□□□□ -0.88
VPS54Q12071 OXA1YER154W 1209 nt9.56□□□□□ -0.88
VPS54Q12071 PAU15YIR041W 375 nt9.56□□□□□ -0.88
VPS54Q12071 FLR1YBR008C 1647 nt9.56□□□□□ -0.88
VPS54Q12071 RPT5YOR117W 1305 nt9.56□□□□□ -0.88
VPS54Q12071 GAL3YDR009W 1563 nt9.55□□□□□ -0.88
VPS54Q12071 FUB1YCR076C 753 nt9.55□□□□□ -0.88
VPS54Q12071 SPT20YOL148C 1815 nt9.54□□□□□ -0.88
VPS54Q12071 DLD2YDL178W 1593 nt9.53□□□□□ -0.88
VPS54Q12071 YER188WYER188W 720 nt9.52□□□□□ -0.89
VPS54Q12071 CPD1YGR247W 720 nt9.52□□□□□ -0.89
VPS54Q12071 FMS1YMR020W 1527 nt9.51□□□□□ -0.89
VPS54Q12071 RAS2YNL098C 969 nt9.5□□□□□ -0.89
VPS54Q12071 RSC8YFR037C 1674 nt9.5□□□□□ -0.89
VPS54Q12071 YPS3YLR121C 1527 nt9.49□□□□□ -0.89
VPS54Q12071 CCT5YJR064W 1689 nt9.48□□□□□ -0.89
VPS54Q12071 TPS1YBR126C 1488 nt9.48□□□□□ -0.89
VPS54Q12071 INA1YLR413W 2028 nt9.48□□□□□ -0.89
VPS54Q12071 RIM8YGL045W 1629 nt9.47□□□□□ -0.89
VPS54Q12071 CWC15YDR163W 528 nt9.47□□□□□ -0.89
VPS54Q12071 RIB7YBR153W 735 nt9.47□□□□□ -0.89
VPS54Q12071 RPC82YPR190C 1965 nt9.46□□□□□ -0.89
VPS54Q12071 SPP2YOR148C 558 nt9.46□□□□□ -0.9
VPS54Q12071 OYE2YHR179W 1203 nt9.45□□□□□ -0.9
VPS54Q12071 HEM13YDR044W 987 nt9.44□□□□□ -0.9
VPS54Q12071 SNZ1YMR096W 894 nt9.44□□□□□ -0.9
VPS54Q12071 EAF3YPR023C 1206 nt9.44□□□□□ -0.9
VPS54Q12071 BSP1YPR171W 1731 nt9.42□□□□□ -0.9
VPS54Q12071 ACH1YBL015W 1581 nt9.42□□□□□ -0.9
VPS54Q12071 OSH7YHR001W 1314 nt9.42□□□□□ -0.9
VPS54Q12071 MET2YNL277W 1461 nt9.41□□□□□ -0.9
VPS54Q12071 YGL114WYGL114W 2178 nt9.4□□□□□ -0.9
VPS54Q12071 THI72YOR192C 1800 nt9.39□□□□□ -0.91
VPS54Q12071 SOL2YCR073W-A 948 nt9.38□□□□□ -0.91
VPS54Q12071 ESS1YJR017C 513 nt9.38□□□□□ -0.91
VPS54Q12071 TAT2YOL020W 1779 nt9.37□□□□□ -0.91
VPS54Q12071 DDI1YER143W 1287 nt9.37□□□□□ -0.91
VPS54Q12071 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt9.37□□□□□ -0.91
VPS54Q12071 MAE1YKL029C 2010 nt9.37□□□□□ -0.91
VPS54Q12071 TMA23YMR269W 636 nt9.36□□□□□ -0.91
VPS54Q12071 LSM5YER146W 282 nt9.35□□□□□ -0.91
VPS54Q12071 YPR126CYPR126C 309 nt9.35□□□□□ -0.91
VPS54Q12071 DAK2YFL053W 1776 nt9.35□□□□□ -0.91
VPS54Q12071 VPS62YGR141W 1404 nt9.33□□□□□ -0.92
VPS54Q12071 YDR455CYDR455C 309 nt9.33□□□□□ -0.92
VPS54Q12071 PAU5YFL020C 369 nt9.32□□□□□ -0.92
VPS54Q12071 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.32□□□□□ -0.92
VPS54Q12071 TAF13YML098W 504 nt9.31□□□□□ -0.92
VPS54Q12071 YOR325WYOR325W 474 nt9.31□□□□□ -0.92
VPS54Q12071 PGC1YPL206C 966 nt9.31□□□□□ -0.92
VPS54Q12071 CTI6YPL181W 1521 nt9.31□□□□□ -0.92
VPS54Q12071 IMO32YGR031W 1029 nt9.28□□□□□ -0.92
VPS54Q12071 YMR262WYMR262W 942 nt9.28□□□□□ -0.92
VPS54Q12071 YDL086WYDL086W 822 nt9.27□□□□□ -0.93
VPS54Q12071 MHF1YOL086W-A 273 nt9.27□□□□□ -0.93
VPS54Q12071 SFP1YLR403W 2052 nt9.27□□□□□ -0.93
VPS54Q12071 MUP1YGR055W 1725 nt9.26□□□□□ -0.93
VPS54Q12071 IML3YBR107C 738 nt9.26□□□□□ -0.93
VPS54Q12071 CCT2YIL142W 1584 nt9.25□□□□□ -0.93
VPS54Q12071 ASP3-1YLR155C 1089 nt9.25□□□□□ -0.93
VPS54Q12071 ASP3-2YLR157C 1089 nt9.25□□□□□ -0.93
VPS54Q12071 ASP3-3YLR158C 1089 nt9.25□□□□□ -0.93
VPS54Q12071 ASP3-4YLR160C 1089 nt9.25□□□□□ -0.93
VPS54Q12071 YNL024CYNL024C 741 nt9.25□□□□□ -0.93
VPS54Q12071 ILV3YJR016C 1758 nt9.24□□□□□ -0.93
VPS54Q12071 POT1YIL160C 1254 nt9.24□□□□□ -0.93
VPS54Q12071 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt9.23□□□□□ -0.93
VPS54Q12071 STP3YLR375W 1032 nt9.23□□□□□ -0.93
VPS54Q12071 YBR232CYBR232C 360 nt9.23□□□□□ -0.93
VPS54Q12071 ERG13YML126C 1476 nt9.22□□□□□ -0.93
VPS54Q12071 OPI10YOL032W 741 nt9.21□□□□□ -0.94
VPS54Q12071 GID7YCL039W 2238 nt9.21□□□□□ -0.94
VPS54Q12071 AIM1YAL046C 357 nt9.2□□□□□ -0.94
VPS54Q12071 SEN2YLR105C 1134 nt9.2□□□□□ -0.94
VPS54Q12071 RRT8YOL048C 1029 nt9.2□□□□□ -0.94
VPS54Q12071 SPS100YHR139C 981 nt9.19□□□□□ -0.94
VPS54Q12071 APS2YJR058C 444 nt9.19□□□□□ -0.94
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