Protein–RNA interactions for Protein: Q01448

HPC2, Histone promoter control protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HPC2Q01448 VRG4YGL225W 1014 nt11.58□□□□□ -0.56
HPC2Q01448 ERG6YML008C 1152 nt11.56□□□□□ -0.56
HPC2Q01448 YIA6YIL006W 1122 nt11.53□□□□□ -0.56
HPC2Q01448 RTN2YDL204W 1182 nt11.52□□□□□ -0.57
HPC2Q01448 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt11.52□□□□□ -0.57
HPC2Q01448 PLB1YMR008C 1995 nt11.51□□□□□ -0.57
HPC2Q01448 SOD2YHR008C 702 nt11.5□□□□□ -0.57
HPC2Q01448 TAF13YML098W 504 nt11.49□□□□□ -0.57
HPC2Q01448 TIP1YBR067C 633 nt11.49□□□□□ -0.57
HPC2Q01448 PAR32YDL173W 888 nt11.47□□□□□ -0.57
HPC2Q01448 YTH1YPR107C 627 nt11.47□□□□□ -0.57
HPC2Q01448 YJL055WYJL055W 738 nt11.46□□□□□ -0.57
HPC2Q01448 UGA4YDL210W 1716 nt11.45□□□□□ -0.58
HPC2Q01448 BOR1YNL275W 1731 nt11.45□□□□□ -0.58
HPC2Q01448 RSC4YKR008W 1878 nt11.43□□□□□ -0.58
HPC2Q01448 SRN2YLR119W 642 nt11.43□□□□□ -0.58
HPC2Q01448 THI72YOR192C 1800 nt11.42□□□□□ -0.58
HPC2Q01448 YHM2YMR241W 945 nt11.42□□□□□ -0.58
HPC2Q01448 QDR2YIL121W 1629 nt11.39□□□□□ -0.59
HPC2Q01448 UTR1YJR049C 1593 nt11.39□□□□□ -0.59
HPC2Q01448 POP2YNR052C 1302 nt11.38□□□□□ -0.59
HPC2Q01448 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt11.38□□□□□ -0.59
HPC2Q01448 SED1YDR077W 1017 nt11.36□□□□□ -0.59
HPC2Q01448 YMR262WYMR262W 942 nt11.36□□□□□ -0.59
HPC2Q01448 BMT5YIL096C 1011 nt11.34□□□□□ -0.59
HPC2Q01448 GSF2YML048W 1212 nt11.34□□□□□ -0.59
HPC2Q01448 HSP60YLR259C 1719 nt11.33□□□□□ -0.6
HPC2Q01448 YER152W-AYER152W-A 567 nt11.32□□□□□ -0.6
HPC2Q01448 NAS6YGR232W 687 nt11.32□□□□□ -0.6
HPC2Q01448 TUB4YLR212C 1422 nt11.32□□□□□ -0.6
HPC2Q01448 CSM1YCR086W 573 nt11.31□□□□□ -0.6
HPC2Q01448 FAF1YIL019W 1041 nt11.31□□□□□ -0.6
HPC2Q01448 GAL3YDR009W 1563 nt11.31□□□□□ -0.6
HPC2Q01448 YCP4YCR004C 744 nt11.3□□□□□ -0.6
HPC2Q01448 HMT1YBR034C 1047 nt11.3□□□□□ -0.6
HPC2Q01448 YER190C-AYER190C-A 576 nt11.29□□□□□ -0.6
HPC2Q01448 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt11.29□□□□□ -0.6
HPC2Q01448 YML133W-AYML133W-A 576 nt11.29□□□□□ -0.6
HPC2Q01448 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt11.29□□□□□ -0.6
HPC2Q01448 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt11.29□□□□□ -0.6
HPC2Q01448 MHF1YOL086W-A 273 nt11.28□□□□□ -0.6
HPC2Q01448 BNS1YGR230W 414 nt11.27□□□□□ -0.61
HPC2Q01448 PUS5YLR165C 765 nt11.27□□□□□ -0.61
HPC2Q01448 LSB5YCL034W 1065 nt11.27□□□□□ -0.61
HPC2Q01448 POT1YIL160C 1254 nt11.26□□□□□ -0.61
HPC2Q01448 SAM35YHR083W 990 nt11.25□□□□□ -0.61
HPC2Q01448 RIB7YBR153W 735 nt11.25□□□□□ -0.61
HPC2Q01448 SNZ1YMR096W 894 nt11.23□□□□□ -0.61
HPC2Q01448 REC114YMR133W 1287 nt11.22□□□□□ -0.61
HPC2Q01448 LIP1YMR298W 453 nt11.22□□□□□ -0.61
HPC2Q01448 FHN1YGR131W 525 nt11.21□□□□□ -0.61
HPC2Q01448 BMT6YLR063W 1098 nt11.21□□□□□ -0.61
HPC2Q01448 RPT5YOR117W 1305 nt11.2□□□□□ -0.62
HPC2Q01448 YPL251WYPL251W 303 nt11.2□□□□□ -0.62
HPC2Q01448 BUD20YLR074C 501 nt11.19□□□□□ -0.62
HPC2Q01448 YPR126CYPR126C 309 nt11.19□□□□□ -0.62
HPC2Q01448 FUR4YBR021W 1902 nt11.19□□□□□ -0.62
HPC2Q01448 APS2YJR058C 444 nt11.17□□□□□ -0.62
HPC2Q01448 SAM50YNL026W 1455 nt11.17□□□□□ -0.62
HPC2Q01448 HIF1YLL022C 1158 nt11.16□□□□□ -0.62
HPC2Q01448 KRE1YNL322C 942 nt11.16□□□□□ -0.62
HPC2Q01448 MEP3YPR138C 1470 nt11.16□□□□□ -0.62
HPC2Q01448 SAM3YPL274W 1764 nt11.15□□□□□ -0.62
HPC2Q01448 NIF3YGL221C 867 nt11.13□□□□□ -0.63
HPC2Q01448 NUC1YJL208C 990 nt11.13□□□□□ -0.63
HPC2Q01448 ATG17YLR423C 1254 nt11.13□□□□□ -0.63
HPC2Q01448 YPL071CYPL071C 471 nt11.13□□□□□ -0.63
HPC2Q01448 LEU9YOR108W 1815 nt11.13□□□□□ -0.63
HPC2Q01448 YMR103CYMR103C 363 nt11.12□□□□□ -0.63
HPC2Q01448 CTI6YPL181W 1521 nt11.12□□□□□ -0.63
HPC2Q01448 MAS1YLR163C 1389 nt11.12□□□□□ -0.63
HPC2Q01448 YGR259CYGR259C 441 nt11.11□□□□□ -0.63
HPC2Q01448 PHO23YNL097C 993 nt11.11□□□□□ -0.63
HPC2Q01448 BRR1YPR057W 1026 nt11.11□□□□□ -0.63
HPC2Q01448 DBP1YPL119C 1854 nt11.1□□□□□ -0.63
HPC2Q01448 SSN3YPL042C 1668 nt11.09□□□□□ -0.63
HPC2Q01448 IGD1YFR017C 588 nt11.09□□□□□ -0.63
HPC2Q01448 IML3YBR107C 738 nt11.09□□□□□ -0.63
HPC2Q01448 YBL086CYBL086C 1401 nt11.09□□□□□ -0.63
HPC2Q01448 PRM5YIL117C 957 nt11.08□□□□□ -0.64
HPC2Q01448 IRC24YIR036C 792 nt11.07□□□□□ -0.64
HPC2Q01448 DAK2YFL053W 1776 nt11.07□□□□□ -0.64
HPC2Q01448 UTP6YDR449C 1323 nt11.07□□□□□ -0.64
HPC2Q01448 KDX1YKL161C 1302 nt11.07□□□□□ -0.64
HPC2Q01448 BSP1YPR171W 1731 nt11.06□□□□□ -0.64
HPC2Q01448 YKR005CYKR005C 1578 nt11.06□□□□□ -0.64
HPC2Q01448 SWM1YDR260C 513 nt11.05□□□□□ -0.64
HPC2Q01448 MSC1YML128C 1542 nt11.04□□□□□ -0.64
HPC2Q01448 BNI5YNL166C 1347 nt11.04□□□□□ -0.64
HPC2Q01448 TOA2YKL058W 369 nt11.03□□□□□ -0.64
HPC2Q01448 YCR025CYCR025C 411 nt11.02□□□□□ -0.65
HPC2Q01448 ARP10YDR106W 855 nt11.02□□□□□ -0.65
HPC2Q01448 HXT1YHR094C 1713 nt11.01□□□□□ -0.65
HPC2Q01448 IPL1YPL209C 1104 nt11□□□□□ -0.65
HPC2Q01448 YNL024CYNL024C 741 nt10.99□□□□□ -0.65
HPC2Q01448 TPS1YBR126C 1488 nt10.99□□□□□ -0.65
HPC2Q01448 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt10.98□□□□□ -0.65
HPC2Q01448 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt10.98□□□□□ -0.65
HPC2Q01448 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt10.98□□□□□ -0.65
HPC2Q01448 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt10.98□□□□□ -0.65
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