Protein–RNA interactions for Protein: P53599

SSK2, MAP kinase kinase kinase SSK2, yeastyeast

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Length 1,579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK2P53599 CSM1YCR086W 573 nt15.28■□□□□ 0.04
SSK2P53599 TAF13YML098W 504 nt15.28■□□□□ 0.04
SSK2P53599 YMR103CYMR103C 363 nt15.28■□□□□ 0.04
SSK2P53599 NUC1YJL208C 990 nt15.25■□□□□ 0.03
SSK2P53599 APS2YJR058C 444 nt15.24■□□□□ 0.03
SSK2P53599 SAM3YPL274W 1764 nt15.24■□□□□ 0.03
SSK2P53599 YIA6YIL006W 1122 nt15.24■□□□□ 0.03
SSK2P53599 SSN3YPL042C 1668 nt15.21■□□□□ 0.03
SSK2P53599 TOA2YKL058W 369 nt15.2■□□□□ 0.02
SSK2P53599 BNI5YNL166C 1347 nt15.18■□□□□ 0.02
SSK2P53599 IRC24YIR036C 792 nt15.18■□□□□ 0.02
SSK2P53599 PAR32YDL173W 888 nt15.16■□□□□ 0.02
SSK2P53599 YER152W-AYER152W-A 567 nt15.16■□□□□ 0.02
SSK2P53599 BMT6YLR063W 1098 nt15.16■□□□□ 0.02
SSK2P53599 GND2YGR256W 1479 nt15.14■□□□□ 0.01
SSK2P53599 HXT1YHR094C 1713 nt15.13■□□□□ 0.01
SSK2P53599 BRR1YPR057W 1026 nt15.13■□□□□ 0.01
SSK2P53599 TUB4YLR212C 1422 nt15.12■□□□□ 0.01
SSK2P53599 YPR126CYPR126C 309 nt15.08■□□□□ 0
SSK2P53599 RIB7YBR153W 735 nt15.07■□□□□ 0
SSK2P53599 RPT5YOR117W 1305 nt15.07■□□□□ 0
SSK2P53599 GSF2YML048W 1212 nt15.07■□□□□ 0
SSK2P53599 DBP1YPL119C 1854 nt15.05■□□□□ -0
SSK2P53599 TRT2tT(CGU)K 72 nt15.04■□□□□ -0
SSK2P53599 MHF1YOL086W-A 273 nt15.02■□□□□ -0
SSK2P53599 SAM2YDR502C 1155 nt15.01□□□□□ -0.01
SSK2P53599 PHO23YNL097C 993 nt15.01□□□□□ -0.01
SSK2P53599 CTI6YPL181W 1521 nt15.01□□□□□ -0.01
SSK2P53599 TPS1YBR126C 1488 nt15□□□□□ -0.01
SSK2P53599 POT1YIL160C 1254 nt15□□□□□ -0.01
SSK2P53599 YCP4YCR004C 744 nt14.99□□□□□ -0.01
SSK2P53599 ACO2YJL200C 2370 nt14.96□□□□□ -0.01
SSK2P53599 PRP4YPR178W 1398 nt14.96□□□□□ -0.01
SSK2P53599 LEU9YOR108W 1815 nt14.95□□□□□ -0.02
SSK2P53599 KRE1YNL322C 942 nt14.95□□□□□ -0.02
SSK2P53599 OYE2YHR179W 1203 nt14.94□□□□□ -0.02
SSK2P53599 DDI1YER143W 1287 nt14.94□□□□□ -0.02
SSK2P53599 DPS1YLL018C 1674 nt14.93□□□□□ -0.02
SSK2P53599 CDD1YLR245C 429 nt14.92□□□□□ -0.02
SSK2P53599 YCR025CYCR025C 411 nt14.91□□□□□ -0.02
SSK2P53599 BUD20YLR074C 501 nt14.91□□□□□ -0.02
SSK2P53599 UFO1YML088W 2007 nt14.9□□□□□ -0.02
SSK2P53599 HIF1YLL022C 1158 nt14.88□□□□□ -0.03
SSK2P53599 SAM50YNL026W 1455 nt14.88□□□□□ -0.03
SSK2P53599 MSC1YML128C 1542 nt14.88□□□□□ -0.03
SSK2P53599 DAK2YFL053W 1776 nt14.87□□□□□ -0.03
SSK2P53599 NIF3YGL221C 867 nt14.85□□□□□ -0.03
SSK2P53599 SNF1YDR477W 1902 nt14.84□□□□□ -0.03
SSK2P53599 SHY1YGR112W 1170 nt14.83□□□□□ -0.04
SSK2P53599 NAS2YIL007C 663 nt14.82□□□□□ -0.04
SSK2P53599 RAS2YNL098C 969 nt14.82□□□□□ -0.04
SSK2P53599 OYE3YPL171C 1203 nt14.82□□□□□ -0.04
SSK2P53599 YER188WYER188W 720 nt14.81□□□□□ -0.04
SSK2P53599 FUB1YCR076C 753 nt14.78□□□□□ -0.04
SSK2P53599 IGD1YFR017C 588 nt14.78□□□□□ -0.04
SSK2P53599 EAF3YPR023C 1206 nt14.78□□□□□ -0.04
SSK2P53599 SEC61YLR378C 1443 nt14.76□□□□□ -0.05
SSK2P53599 LYS20YDL182W 1287 nt14.75□□□□□ -0.05
SSK2P53599 FLR1YBR008C 1647 nt14.74□□□□□ -0.05
SSK2P53599 LSM5YER146W 282 nt14.72□□□□□ -0.05
SSK2P53599 TMA23YMR269W 636 nt14.72□□□□□ -0.05
SSK2P53599 YNL024CYNL024C 741 nt14.71□□□□□ -0.05
SSK2P53599 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt14.7□□□□□ -0.06
SSK2P53599 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt14.7□□□□□ -0.06
SSK2P53599 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt14.7□□□□□ -0.06
SSK2P53599 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt14.7□□□□□ -0.06
SSK2P53599 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt14.7□□□□□ -0.06
SSK2P53599 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt14.7□□□□□ -0.06
SSK2P53599 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt14.7□□□□□ -0.06
SSK2P53599 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt14.7□□□□□ -0.06
SSK2P53599 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt14.7□□□□□ -0.06
SSK2P53599 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt14.7□□□□□ -0.06
SSK2P53599 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt14.7□□□□□ -0.06
SSK2P53599 SPE2YOL052C 1191 nt14.69□□□□□ -0.06
SSK2P53599 IML3YBR107C 738 nt14.69□□□□□ -0.06
SSK2P53599 ADE8YDR408C 645 nt14.67□□□□□ -0.06
SSK2P53599 FLX1YIL134W 936 nt14.66□□□□□ -0.06
SSK2P53599 RSC8YFR037C 1674 nt14.65□□□□□ -0.06
SSK2P53599 SPS100YHR139C 981 nt14.62□□□□□ -0.07
SSK2P53599 IPL1YPL209C 1104 nt14.62□□□□□ -0.07
SSK2P53599 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt14.61□□□□□ -0.07
SSK2P53599 TGA1tA(UGC)A 73 nt14.6□□□□□ -0.07
SSK2P53599 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt14.6□□□□□ -0.07
SSK2P53599 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt14.6□□□□□ -0.07
SSK2P53599 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt14.6□□□□□ -0.07
SSK2P53599 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt14.6□□□□□ -0.07
SSK2P53599 OSH7YHR001W 1314 nt14.59□□□□□ -0.07
SSK2P53599 SWM1YDR260C 513 nt14.59□□□□□ -0.07
SSK2P53599 URA6YKL024C 615 nt14.59□□□□□ -0.07
SSK2P53599 DLD2YDL178W 1593 nt14.58□□□□□ -0.08
SSK2P53599 ABZ2YMR289W 1125 nt14.57□□□□□ -0.08
SSK2P53599 SOL2YCR073W-A 948 nt14.55□□□□□ -0.08
SSK2P53599 ADH3YMR083W 1128 nt14.55□□□□□ -0.08
SSK2P53599 PET8YNL003C 855 nt14.55□□□□□ -0.08
SSK2P53599 YPS3YLR121C 1527 nt14.54□□□□□ -0.08
SSK2P53599 FCY1YPR062W 477 nt14.53□□□□□ -0.08
SSK2P53599 YDR455CYDR455C 309 nt14.51□□□□□ -0.09
SSK2P53599 OXA1YER154W 1209 nt14.51□□□□□ -0.09
SSK2P53599 PHB2YGR231C 933 nt14.51□□□□□ -0.09
SSK2P53599 SPP2YOR148C 558 nt14.51□□□□□ -0.09
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