Protein–RNA interactions for Protein: P53551

HHO1, Histone H1, yeastyeast

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HHO1P53551 BDH1YAL060W 1149 nt7.8□□□□□ -1.16
HHO1P53551 TPN1YGL186C 1740 nt7.8□□□□□ -1.16
HHO1P53551 FMS1YMR020W 1527 nt7.79□□□□□ -1.16
HHO1P53551 YER190C-AYER190C-A 576 nt7.79□□□□□ -1.16
HHO1P53551 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt7.79□□□□□ -1.16
HHO1P53551 TOA2YKL058W 369 nt7.79□□□□□ -1.16
HHO1P53551 YML133W-AYML133W-A 576 nt7.79□□□□□ -1.16
HHO1P53551 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt7.79□□□□□ -1.16
HHO1P53551 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt7.79□□□□□ -1.16
HHO1P53551 FIT1YDR534C 1587 nt7.79□□□□□ -1.16
HHO1P53551 SED1YDR077W 1017 nt7.78□□□□□ -1.16
HHO1P53551 YHR219WYHR219W 1875 nt7.77□□□□□ -1.17
HHO1P53551 POM34YLR018C 900 nt7.77□□□□□ -1.17
HHO1P53551 YKL030WYKL030W 606 nt7.76□□□□□ -1.17
HHO1P53551 CWP2YKL096W-A 279 nt7.76□□□□□ -1.17
HHO1P53551 GND2YGR256W 1479 nt7.75□□□□□ -1.17
HHO1P53551 BRR1YPR057W 1026 nt7.73□□□□□ -1.17
HHO1P53551 RPD3YNL330C 1302 nt7.73□□□□□ -1.17
HHO1P53551 LEU9YOR108W 1815 nt7.73□□□□□ -1.17
HHO1P53551 YRF1-2YER190W 5046 nt7.73□□□□□ -1.17
HHO1P53551 HBS1YKR084C 1836 nt7.71□□□□□ -1.17
HHO1P53551 LSM5YER146W 282 nt7.7□□□□□ -1.18
HHO1P53551 YML089CYML089C 369 nt7.7□□□□□ -1.18
HHO1P53551 YMR262WYMR262W 942 nt7.7□□□□□ -1.18
HHO1P53551 YPS3YLR121C 1527 nt7.69□□□□□ -1.18
HHO1P53551 SAM2YDR502C 1155 nt7.69□□□□□ -1.18
HHO1P53551 TOM71YHR117W 1920 nt7.68□□□□□ -1.18
HHO1P53551 TRT2tT(CGU)K 72 nt7.68□□□□□ -1.18
HHO1P53551 YPL251WYPL251W 303 nt7.67□□□□□ -1.18
HHO1P53551 FLR1YBR008C 1647 nt7.67□□□□□ -1.18
HHO1P53551 DUS3YLR401C 2007 nt7.66□□□□□ -1.18
HHO1P53551 INH1YDL181W 258 nt7.66□□□□□ -1.18
HHO1P53551 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt7.65□□□□□ -1.18
HHO1P53551 IMT4tM(CAU)E 72 nt7.65□□□□□ -1.18
HHO1P53551 IMT3tM(CAU)J3 72 nt7.65□□□□□ -1.18
HHO1P53551 IMT1tM(CAU)O1 72 nt7.65□□□□□ -1.18
HHO1P53551 IMT2tM(CAU)P 72 nt7.65□□□□□ -1.18
HHO1P53551 YAR028WYAR028W 705 nt7.65□□□□□ -1.18
HHO1P53551 FET5YFL041W 1869 nt7.64□□□□□ -1.19
HHO1P53551 UTH1YKR042W 1098 nt7.64□□□□□ -1.19
HHO1P53551 POP2YNR052C 1302 nt7.63□□□□□ -1.19
HHO1P53551 MET30YIL046W 1923 nt7.63□□□□□ -1.19
HHO1P53551 snR4snR4 186 nt7.63□□□□□ -1.19
HHO1P53551 DLD3YEL071W 1491 nt7.62□□□□□ -1.19
HHO1P53551 DUR3YHL016C 2208 nt7.62□□□□□ -1.19
HHO1P53551 TOM6YOR045W 186 nt7.62□□□□□ -1.19
HHO1P53551 MSF1YPR047W 1410 nt7.61□□□□□ -1.19
HHO1P53551 YLR046CYLR046C 813 nt7.61□□□□□ -1.19
HHO1P53551 ORT1YOR130C 879 nt7.61□□□□□ -1.19
HHO1P53551 DLD2YDL178W 1593 nt7.6□□□□□ -1.19
HHO1P53551 HIP1YGR191W 1812 nt7.6□□□□□ -1.19
HHO1P53551 SPP1YPL138C 1062 nt7.6□□□□□ -1.19
HHO1P53551 RIM2YBR192W 1134 nt7.6□□□□□ -1.19
HHO1P53551 YSP3YOR003W 1437 nt7.6□□□□□ -1.19
HHO1P53551 HEM14YER014W 1620 nt7.6□□□□□ -1.19
HHO1P53551 AIM1YAL046C 357 nt7.59□□□□□ -1.19
HHO1P53551 YMR103CYMR103C 363 nt7.59□□□□□ -1.19
HHO1P53551 RPC31YNL151C 756 nt7.59□□□□□ -1.19
HHO1P53551 YNL190WYNL190W 615 nt7.58□□□□□ -1.2
HHO1P53551 ADE16YLR028C 1776 nt7.58□□□□□ -1.2
HHO1P53551 LEU4YNL104C 1860 nt7.58□□□□□ -1.2
HHO1P53551 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt7.57□□□□□ -1.2
HHO1P53551 TIP1YBR067C 633 nt7.57□□□□□ -1.2
HHO1P53551 HXT12YIL170W 1374 nt7.57□□□□□ -1.2
HHO1P53551 NPP2YEL016C 1482 nt7.56□□□□□ -1.2
HHO1P53551 MTG2YHR168W 1557 nt7.56□□□□□ -1.2
HHO1P53551 HEM13YDR044W 987 nt7.55□□□□□ -1.2
HHO1P53551 AKR2YOR034C 2250 nt7.54□□□□□ -1.2
HHO1P53551 TRP2YER090W 1524 nt7.54□□□□□ -1.2
HHO1P53551 TIF6YPR016C 738 nt7.54□□□□□ -1.2
HHO1P53551 DPL1YDR294C 1770 nt7.53□□□□□ -1.2
HHO1P53551 ALR1YOL130W 2580 nt7.53□□□□□ -1.2
HHO1P53551 PEX2YJL210W 816 nt7.52□□□□□ -1.21
HHO1P53551 VMA11YPL234C 495 nt7.52□□□□□ -1.21
HHO1P53551 SEC61YLR378C 1443 nt7.52□□□□□ -1.21
HHO1P53551 HSV2YGR223C 1347 nt7.52□□□□□ -1.21
HHO1P53551 PFS2YNL317W 1398 nt7.51□□□□□ -1.21
HHO1P53551 ITR2YOL103W 1830 nt7.51□□□□□ -1.21
HHO1P53551 SFL1YOR140W 2301 nt7.5□□□□□ -1.21
HHO1P53551 ENT4YLL038C 744 nt7.49□□□□□ -1.21
HHO1P53551 PRE6YOL038W 765 nt7.49□□□□□ -1.21
HHO1P53551 SFA1YDL168W 1161 nt7.48□□□□□ -1.21
HHO1P53551 YNL115CYNL115C 1935 nt7.48□□□□□ -1.21
HHO1P53551 THI6YPL214C 1623 nt7.48□□□□□ -1.21
HHO1P53551 HXT11YOL156W 1704 nt7.47□□□□□ -1.21
HHO1P53551 LAS17YOR181W 1902 nt7.47□□□□□ -1.21
HHO1P53551 KRR1YCL059C 951 nt7.47□□□□□ -1.21
HHO1P53551 YDR467CYDR467C 327 nt7.47□□□□□ -1.21
HHO1P53551 SNX3YOR357C 489 nt7.47□□□□□ -1.21
HHO1P53551 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt7.46□□□□□ -1.22
HHO1P53551 AIM34YMR003W 597 nt7.46□□□□□ -1.22
HHO1P53551 ALP1YNL270C 1722 nt7.46□□□□□ -1.22
HHO1P53551 OSH7YHR001W 1314 nt7.45□□□□□ -1.22
HHO1P53551 SRM1YGL097W 1449 nt7.44□□□□□ -1.22
HHO1P53551 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.44□□□□□ -1.22
HHO1P53551 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.44□□□□□ -1.22
HHO1P53551 OXA1YER154W 1209 nt7.44□□□□□ -1.22
HHO1P53551 CHA1YCL064C 1083 nt7.43□□□□□ -1.22
HHO1P53551 YER188WYER188W 720 nt7.43□□□□□ -1.22
HHO1P53551 EMC3YKL207W 762 nt7.43□□□□□ -1.22
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